GC Content in Plant Genomes

BUREŠ, Petr, Petr ŠMARDA, Ivana HRALOVÁ, Sara FUNES-SORIANO, Martin LYSÁK, Radomír ŘEPKA, Klára HELÁNOVÁ, Olga ROTREKLOVÁ, Jana PROCHÁZKOVÁ, Luboš ÚRADNÍČEK a Jana KŮROVÁ. GC Content in Plant Genomes. In Analytical Cytometry IV. Brno: Czech Society for Analytical Cytometry, 2007, s. 19-20. ISBN 978-80-239-9591-6.

Základní údaje

Originální název

GC Content in Plant Genomes

Název česky

GCbsah v rostlinných genomech

Autoři

BUREŠ, Petr (203 Česká republika, garant, domácí), Petr ŠMARDA (203 Česká republika, domácí), Ivana HRALOVÁ (203 Česká republika), Sara FUNES-SORIANO (484 Mexiko), Martin LYSÁK (203 Česká republika, domácí), Radomír ŘEPKA (203 Česká republika), Klára HELÁNOVÁ (203 Česká republika, domácí), Olga ROTREKLOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jana PROCHÁZKOVÁ (203 Česká republika), Luboš ÚRADNÍČEK (203 Česká republika) a Jana KŮROVÁ (203 Česká republika)

Vydání

Brno, Analytical Cytometry IV, od s. 19-20, 2 s. 2007

Nakladatel

Czech Society for Analytical Cytometry

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00022323

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-239-9591-6

Klíčová slova anglicky

Genome size; base composition; Carex; Eleocharis; Festuca; Apiaceae; Brassicaceae; Epilobium; Salix

Štítky

Apiaceae, base composition, Brassicaceae, Carex, Eleocharis, Epilobium, Festuca, genome size, Salix

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

GC base pair content is an important character in the description of new taxa of prokaryotes, but its role in plant systematics and evolution is still poorly understood. Using flow cytometry methods (FCM) with PI and DAPI, we estimated base composition in Apiaceae (16 spp.), Brassicaceae (30 spp.), Cyperaceae (135 spp.), Onagraceae (15 spp.), Poaceae (132 spp.) and Salicaceae (20 spp.), and found a significant positive correlation between GC content and genome size.

Česky

Obsah GC bazí je znakem používáným obecně zejména v taxonomii prokaryot, avšak jeho role v evoluci rostlin zůstává zatím nejasná. S použitím průtokové cytometrie jsme stanovili zastoupení bazí v genomech Apiaceae (16 spp.), Brassicaceae (30 spp.), Cyperaceae (135 spp.), Onagraceae (15 spp.), Poaceae (132 spp.) a Salicaceae (20 spp.). Nalezli jsme v rámci těchto příbuzenských okruhů signifikantní klorelaci mezi velikostí genomu a zastoupením GC bazí.

---

Návaznosti

LC06073, projekt VaV	Název: Centrum pro výzkum biodiverzity Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr	Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase