D 2007

Genomová struktura spirochet rodu Treponema.

ŠMAJS, David; Petra MATĚJKOVÁ; Michal STROUHAL; Darina ČEJKOVÁ; Marie ZOBANÍKOVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Genomová struktura spirochet rodu Treponema.

Název česky

Genomová struktura spirochet rodu Treponema.

Název anglicky

Genome structure of the Treponema spirochetes.

Autoři

Vydání

Liberec, 24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty. od s. 62-62, 1 s. 2007

Nakladatel

Československá společnost mikrobiologická

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISSN

Klíčová slova anglicky

Genome structure; Treponema; spirochete
Změněno: 7. 4. 2010 16:41, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.

Anotace

V originále

Byly získány genomové sekvence sedmi zástupců rodu Treponema, t.j. 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols, SS14, Dal-1), 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pertenue (CDC2, Gauthier, Samoa D) a Treponema paraluiscuniculi kmene Cuniculi A. Získané genomové sekvence byly porovnány a nalezené rozdíly byly korelovány s mírou patogenity a invazivity jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů. Sekvenční rozdíly mezi genomy stejného poddruhu sloužily pro definování rozsahu genetické variability uvnitř poddruhu a k identifikaci genetických rozdílů odpovědných za odlišnou míru patogenity jednotlivých kmenů. Mezipoddruhové rozdíly pak určovaly různou míru patogenity mezi poddruhy pallidum a pertenue. Mezidruhové rozdíly definovaly rozdíly mezi patogenními a nepatogenními spirochetami. Porovnáním genomů jsme identifikovali variabilní úseky genomů, které mohou sloužit pro molekulární identifikaci jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů.

Anglicky

Genome structure of the spirochetal strains belonging to the genus Treponema is shown and discussed.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů