2007
In vitro and in silico protein engineering of lectins
WIMMEROVÁ, MichaelaZákladní údaje
Originální název
In vitro and in silico protein engineering of lectins
Název česky
Proteinové inženýrství lektinů in vitro a in silico
Autoři
Vydání
Lubeck (Germany), 14th European Carbohydrate Symposium, EUROCARB 14, s. 147-147, 2007
Nakladatel
Research Center Borstel and the Institute of Chemistry
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Německo
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
mutagenesis; structure; lectin; pathogen
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 12. 11. 2007 17:41, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
V originále
The contribution is focused on bacterial lectins from human opportunistic pathogens, which display sub-micromolar range affinity towards their carbohydrate ligands, targeting specially proteins from bacteria dangerous for cystic fibrosis patients. The combination of binding experiments (isothermal titration microcalorimetry, surface plasmon resonance,...) and X-ray crystallography approaches is used to decipher the thermodynamical and structural basis for high affinity binding of these lectins to host carbohydrates. Site-directed mutagenesis in combination with structural and functional studies is used to understandthe role of particular amino acids for sugar specificity and preference. In order to explore these interesting features deeper, we have been using a computational chemistry approach with the graphic program TRITON that is being under development at our institute. TRITON automates in silico engineering of proteins by generation of desired mutant proteins and performs docking experiments using AUTODOCK [2]. The TRITON results are correlated with experimental data.
Česky
Proteinové inženýrství lektinů in vitro a in silico
Návaznosti
| LC06030, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622413, záměr |
|