Acquiarium 1.0

MATULA, Pavel, Martin MAŠKA, Ondřej DANĚK, Petr MATULA, Michal KOZUBEK a Petr KRONTORÁD. Acquiarium 1.0. 2007.

Základní údaje

Originální název

Acquiarium 1.0

Název česky

Acquiarium 1.0

Autoři

MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant), Martin MAŠKA (203 Česká republika), Ondřej DANĚK (203 Česká republika), Petr MATULA (203 Česká republika), Michal KOZUBEK (203 Česká republika) a Petr KRONTORÁD (203 Česká republika)

Vydání

2007

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Kód RIV

RIV/00216224:14330/07:00025677

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

image acquisition; image correction; automated image analysis; fluorescence microscopy

Technické parametry

free software distributed as binaries; written in C++ language

Štítky

automated image analysis, fluorescence microscopy, image acquisition, image correction

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

Acquiarium is an image acquisition and analysis software for high-resolution 3D cytometry. Its main goal is to provide tools for high-quality evaluation of spatial arrangement of fluorescently labeled targets in a large number of cells. The idea is to link high-throughput acquisition using spinning-disk confocal microscopes with appropriate software tools for automated 3D image analysis. Version 1.0 is described at http://cbia.fi.muni.cz/projects/acquiarium-version-1.0.html

Česky

Acquiarium je software na snímání obrazu a analýzu obrazu pro účely 3D cytometrie s vysokým rozlišením. Jeho hlavním cílem je poskytnout nástroje na vysoce kvalitní vyhodnocení prostorového uspořádání fluorescenčně označených cílů ve velkém množství buněk. Hlavní myšlenka tkví v propojení rychlého snímání obrazu pomocí konfokálních mikroskopů s rotujícím diskem a náležitými nástroji pro automatickou 3D obrazovou analýzu. Verze 1.0 je popsána na http://cbia.fi.muni.cz/projects/acquiarium-version-1.0.html

---

Návaznosti

2B06052, projekt VaV

Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů