J 2007

Real-time PCR diagnostics failure caused by nucleotide variability withing exos 4 of human cytomegalovirus major immediate-early gene

LENGEROVÁ, Martina; Zdeněk RÁČIL; Pavlína VOLFOVÁ; Jana LOCHMANOVÁ; Jitka BERKOVCOVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Real-time PCR diagnostics failure caused by nucleotide variability withing exos 4 of human cytomegalovirus major immediate-early gene

Autoři

LENGEROVÁ, Martina; Zdeněk RÁČIL; Pavlína VOLFOVÁ; Jana LOCHMANOVÁ; Jitka BERKOVCOVÁ; Dana DVOŘÁKOVÁ; Jiří VORLÍČEK a Jiří MAYER

Vydání

Journal of Clinical Microbiology, 2007, 0095-1137

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.708

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

UT WoS

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 3. 11. 2010 14:05, prof. MUDr. Zdeněk Ráčil, Ph.D.

Anotace

V originále

Here we report how variability in the human cytomegalovirus genome sequence may seriously affect the outcome of its molecular diagnosis. A real-time quantitative PCR assay targeting the major immediate-early gene failed to detect the viral load in some, but not all, clinical samples from hematooncological patients. By amplification and sequencing the DNA across the regions targeted by this assay we found a number of nucleotide substitutions which accounted for decreased primer/probe binding. This decreased the sensitivity of the assay up to 1,000-fold.