J 2008

Two-dimensional condensation of pyrimidine oligonucleotides during their self-assemblies at mercury based surfaces.

HASOŇ, Stanislav, Vladimír VETTERL a Miroslav FOJTA

Základní údaje

Originální název

Two-dimensional condensation of pyrimidine oligonucleotides during their self-assemblies at mercury based surfaces.

Název česky

Dvojrozměrná kondenzace pyrimidinových oligonukleotidů během jejich samouspořádání na rtuťových površích.

Autoři

HASOŇ, Stanislav (203 Česká republika), Vladimír VETTERL (203 Česká republika, garant) a Miroslav FOJTA (203 Česká republika)

Vydání

Electrochimica Acta, Amsterdam, Elsevier Science, 2008, 0013-4686

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10610 Biophysics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.078

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00024608

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000253213600020

Klíčová slova anglicky

Oligonucleotides; adsorption; two-dimensional condensation; hanging mercury drop electrode; solid amalgam electrode; AC impedance measurements

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 21. 1. 2008 10:15, prof. RNDr. Vladimír Vetterl, DrSc.

Anotace

V originále

For the first time it is shown that homopyrimidine oligodeoxynucleotides (ODNs) adsorbed at mercury or amalgam electrode surface can condensate upon applying negative potentials (around -1.35 V vs. Ag/AgCl/3M KCl). This 2D condensation resulted in formation of capacitance pits on the C-E curves resembling those observed earlier with monomeric nucleic acid bases, nucleosides and nucleotides. Differences in behavior of the condensed layers of dT30 and dC30 ODNs, reflecting different physico-chemical and electrochemical properties of thymine and cytosine, were observed. Formation of the ODN condensed film involved reorientation of the oligonucleotide molecules firmly adsorbed at the electrode and took place even in the absence of any ODN in the bulk of solution. Homopurine ODNs did not form these two-dimensional (2D) condensed monolayers under the same conditions. A preliminary thermodynamic analysis of the condensed ODN layers is presented.

Česky

Po prvé je ukázáno, že homopyrimidinové oligodeoxynukleotidy (ODN) adsorbované na povrchu rtuťové nebo amalgamové elektrody mohou při záporných potenciálech (v okolí -1.35 V vs. Ag/AgCl/3M KCl) kondenzovat. V důsledku této dvojrozměrné kondenzace vznikají na C-E křivkách kapacitní jámy připomínající ty, které byly dříve pozorovány s monomerními bazemi nukleových kyselin, nukleosidy a nukleotidy. Bylo pozorovány rozdíly v chování kondenzovaných vrstev oligodeoxynukleotidů dT30 a dC30 v důsledku rozdílných fyzikálně-chemických a elektrochemických vlastností thyminu a cytosinu. Kondenzovaný film ODN vzniká reorientací ODN molekul adsorbovaných na povrchu elektrody, ke které dochází i když v okolním roztoku žádné ODN molekuly nejsou. Homopurinové oligodeoxynukleotidy netvoří 2D kondenzované monovrstvy. Je uvedena předběžná termodynamická analyza kondenzovaných vrstev ODN.

Návaznosti

GA202/08/1688, projekt VaV
Název: Využití fyzikálních metod studia adsorpce nukleových kyselin a proteinů na rozhraních v lékařské diagnostice a při studiu biokompatibility
GA203/07/1195, projekt VaV
Název: Analýza struktury a interakcí DNA pomocí elektrochemických technik a chemických sond. Nové metody a senzory pro detekci poškození DNA