BROŽKOVÁ, Kristýna, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Pavel BOUCHAL, Jitka HOLČÁKOVÁ, Eva MICHALOVÁ, Rostislav VYZULA, Jan ŽALOUDÍK, Dalibor VALÍK, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Identifikace potenciálních biomarkerů karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS (Identification of potencial biomarkers of breast cancer by SELDI-TOF MS). Klinická onkologie. Brno: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2007, vol. 20, No 6, p. 377-383. ISSN 0862-495X.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Identifikace potenciálních biomarkerů karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS
Name in Czech Identifikace potenciálních biomarkerů karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS
Name (in English) Identification of potencial biomarkers of breast cancer by SELDI-TOF MS
Authors BROŽKOVÁ, Kristýna (203 Czech Republic, guarantor), Dana KNOFLÍČKOVÁ (203 Czech Republic), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Czech Republic), Pavel BOUCHAL (203 Czech Republic), Jitka HOLČÁKOVÁ (203 Czech Republic), Eva MICHALOVÁ (203 Czech Republic), Rostislav VYZULA (203 Czech Republic), Jan ŽALOUDÍK (203 Czech Republic), Dalibor VALÍK (203 Czech Republic), Rudolf NENUTIL (203 Czech Republic) and Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Czech Republic).
Edition Klinická onkologie, Brno, Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2007, 0862-495X.
Other information
Original language Czech
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 30200 3.2 Clinical medicine
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/07:00028194
Organization unit Faculty of Science
Keywords in English SELDI-TOF MS; biological marker; breast cancer; beta-globin
Tags beta-globin, biological marker, breast cancer, SELDI-TOF MS
Changed by Changed by: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Changed: 13/11/2008 14:50.
Abstract
Východisko: Včasná diagnóza a rychlé nasazení cílené terapie jsou klíčovými faktory úspěšnosti léčby nádorových onemocnění. Snaha o nalezení nových biomarkerů pro včasnější diagnostiku, bližší určení subtypu nádoru, výběr optimálního léčebného protokolu a stanovení prognózy odpovídavosti na léčbu stále zůstává jedním z hlavních cílů výzkumu v této oblasti. V naší studii jsme se zaměřili na diferenciální analýzu proteinových expresních profilů nádorové a normální tkáně 105 pacientek s diagnózou karcinomu prsu. Metody a výsledky: Lyzáty tkání byly analyzovány metodou SELDI-TOF MS s využitím čipů s povrchem chelatujícím měďnaté kationty (IMAC 30). Intenzity signálů odpovídajících jednotlivým proteinům vzorku byly statisticky hodnoceny pomocí Wilcoxonova testu na hladině významnosti p<0,01. Bylo nalezeno 28 signálů se signifikantně vyšší hodnotou intenzity v nádorové tkáni a 18 signálů o vyšší intenzitě v normální tkáni prsu. Metodou peptidového mapování (PMF) byl identifikován protein specifický pro normální tkáň s charakteristickým signálem o molekulové hmotnosti 15841 Da jako beta-řetězec hemoglobinu. Závěr: Analýza metodou SELDI-TOF MS prokázala významné rozdíly v hmotnostních spektrech proteinů exprimovaných v nádorové a normální tkáni. Na základě získaných spekter bylo možno vytipovat charakteristické píky označující proteiny, jenž lze považovat za potenciální biomarkery onemocnění a které by mohly v budoucnosti poskytnout přesnější pohled na klasifikaci nádorů a tím i na jejich diagnostiku a terapii.
Abstract (in English)
Backgrounds: Early diagnosis and immediate therapeutic interventions are crucial factors for successful cancer treatment. New biomarkers are needed for even earlier diagnosis, more precise histopatological classification or for prediction of treatment response. Our study was aimed at the differential analysis of protein expression profiles of cancer and non-cancer tissue from 105 patients with breast cancer. Methods and Results: Tissue lysates were analysed by SELDI-TOF MS on copper chelating chips IMAC 30. Peak intensities were statistically evaluated by Wilcoxon test with p<0,01. 28 peaks are over expressed in tumour tissue and 18 peaks are over expressed in normal tissue. Protein with molecular weight 15841 Da was identified as beta chain of haemoglobin by method peptide mass fingerprint (PMF). Conclusions: Analysis of protein expression profile by SELDI-TOF MS is able to provide a new point of view on diagnostic and tumour classification. Further independent studies of new sets of samples are essential for verification of specificity and sensitivity of published potential biomarkers.
Links
NR8338, research and development projectName: Funkční analýza drah regulovaných proteinem p53 u nádorů prsu: Integrace genomických a proteomických přístupů zahrnujících techniky DNA-macroarray a hmotnostní spektrometrii na principu SELDI-TOF
PrintDisplayed: 15/5/2024 03:39