STROUHAL, Michal, David ŠMAJS, Petra MATĚJKOVÁ, Erica SODERGREN, Anita G. AMIN, Jerrilyn K. HOWELL, Steven J. NORRIS a George M. WEINSTOCK. Genome Differences between Treponema pallidum subsp. pallidum Strain Nichols and T. paraluiscuniculi Strain Cuniculi A. INFECTION AND IMMUNITY, The American Society for Microbiology, 2007, roč. 75, č. 12, s. 5859-5866. ISSN 0019-9567.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Genome Differences between Treponema pallidum subsp. pallidum Strain Nichols and T. paraluiscuniculi Strain Cuniculi A
Název česky Genomové rozdíly mezi Treponema pallidum subsp. pallidum Nichols a T. paraluiscuniculi Cuniculi A
Autoři STROUHAL, Michal (203 Česká republika), David ŠMAJS (203 Česká republika, garant), Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika), Erica SODERGREN (840 Spojené státy americké), Anita G. AMIN (840 Spojené státy americké), Jerrilyn K. HOWELL (840 Spojené státy americké), Steven J. NORRIS (840 Spojené státy americké) a George M. WEINSTOCK (840 Spojené státy americké).
Vydání INFECTION AND IMMUNITY, The American Society for Microbiology, 2007, 0019-9567.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené státy americké
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.996
Kód RIV RIV/00216224:14110/07:00019192
Organizační jednotka Lékařská fakulta
UT WoS 000251341500036
Klíčová slova anglicky Treponema pallidum; Treponema paraluiscuniculi; restriction analysis
Štítky restriction analysis, Treponema pallidum, Treponema paraluiscuniculi
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 25. 6. 2009 15:47.
Anotace
The genome of Treponema paraluiscuniculi strain Cuniculi A was compared to the genome of the syphilis spirochete Treponema pallidum subsp. pallidum strain Nichols using DNA microarray hybridization, whole-genome fingerprinting, and DNA sequencing. Using these approaches, deletions, insertions, and prominent sequence changes were found in 38 gene homologs and six intergenic regions of the Cuniculi A genome when it was compared to the genome of T. pallidum subsp. pallidum Nichols. Most of the observed differences were localized in tpr loci and the vicinity of these loci. In addition, 14 other genes were found to contain frameshift mutations resulting in major changes in protein sequences. Analysis of restriction target sites representing 0.34% of the total genome length and DNA sequencing of three PCR products (0.46% of the total genome length) amplified from Cuniculi A chromosomal regions and comparison to the Nichols genome revealed a sequence similarity of 98.6 to 99.3%. These results are consistent with a close genetic relationship among the T. pallidum strains and subspecies and a strong, but relatively divergent connection between the human and rabbit pathogens.
Anotace česky
Byly identifikovány genomové rozdíly mezi Treponema pallidum subsp. pallidum Nichols a T. paraluiscuniculi Cuniculi A. Tyto výsledky byly diskutovány v kontextu dalších dat.
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Resortní program výzkumu a vývoje - MZ
VytisknoutZobrazeno: 21. 2. 2020 05:38