J 2007

Pyrosequencing as a tool for whole genome sequencing of Treponema pallidum subspecies.

ČEJKOVÁ, Darina, Petra MATĚJKOVÁ, Michal STROUHAL, Marie ZOBANÍKOVÁ, David ŠMAJS et. al.

Basic information

Original name

Pyrosequencing as a tool for whole genome sequencing of Treponema pallidum subspecies.

Name in Czech

Pyrosekvenace jako nástroj pro celogenomové sekvencování Treponema pallidum.

Authors

ČEJKOVÁ, Darina (203 Czech Republic), Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic), Michal STROUHAL (203 Czech Republic), Marie ZOBANÍKOVÁ (203 Czech Republic), David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor) and George M. WEINSTOCK (840 United States of America)

Edition

Chemické Listy, Praha, Asociace českých chemických společností, 2007, 0009-2770

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

Impact factor

Impact factor: 0.683

RIV identification code

RIV/00216224:14110/07:00019193

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords in English

pyrosequencing; Treponema pallidum
Změněno: 6/2/2008 14:25, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Abstract

V originále

Treponema pallidum includes several obligate human pathogens. T. p. pallidum is an agent of sexually transmitted syphilis, T. p. pertenue and T. p. endemicum causes yaws and endemic syphilis, respectively. Pyrosequencing (454 sequencing) is a massivelyparallel sequencing-by-synthesis system. In this study, genomic DNA of T. p. pertenue CDC-2 was completely sequenced using 454 technology.

In Czech

Pyrosekvenace je prezentována jako nástroj pro celogenomové sekvencování Treponema pallidum.

Links

GA310/07/0321, research and development project
Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Czech Science Foundation
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NR8967, research and development project
Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministry of Health of the CR