Automation of biomedical image acquisition and processing in optical microscopy: Exploring the structure and function of human genome

KOZUBEK, Michal. Automation of biomedical image acquisition and processing in optical microscopy: Exploring the structure and function of human genome. In Seminar of the Centre for Applied Medical Research. 2006.

Základní údaje

Originální název

Automation of biomedical image acquisition and processing in optical microscopy: Exploring the structure and function of human genome

Název česky

Automatizace pořizování a zpracování biomedicínských obrazů v optické mikroskopii: Výzkum struktury a funkce lidského genomu

Autoři

KOZUBEK, Michal

Vydání

Seminar of the Centre for Applied Medical Research, 2006

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Prezentace na konferencích

Obor

20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering

Stát vydavatele

Španělsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

automated microscopy

Štítky

automated microscopy

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

Biomedical image data can be produced by different instruments. For the exploration of the spatial structure and function of human genome, the most frequent instrument is optical microscope (typically cells or their components stained with fluorescent dyes are observed). The image formed in the microscope is recorded using a special low-light camera, transferred to computer memory and analysed by computer. Although camera is a two-dimensional device, more dimensions can be acquired using scanning (e.g., third spatial dimension, spectral dimension, time dimension or viewing angle dimension). Due to the increasing complexity and volume, the resulting multidimensional data often need computer analysis with a high degree of automation. The talk will attend to the computer analysis of different types of biomedical image data generated by optical microscopy and related automation efforts. It will be accompanied by examples on fixed cells, on live cells as well as on cDNA-microarrays.

Česky

Přednáška se zabývala automatizací pořizování a zpracování biomedicínských obrazů v optické mikroskopii se zaměřením na výzkum struktury a funkce lidského genomu.

---

Návaznosti

LC535, projekt VaV	Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr	Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
2B06052, projekt VaV	Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů