J 2007

Genotyping of selected potato cultivars based on structural variation of telomere-associated chromosome regions

FAJKUS, Jiří; Eva SÝKOROVÁ; Kamila NEPLECHOVÁ; Petr DĚDIČ; Marcela ŠEFČÍKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Genotyping of selected potato cultivars based on structural variation of telomere-associated chromosome regions

Název česky

Genotypizace vybraných odrůd bramboru založená na strukturální variabilitě telomer asociovaných oblastí chromozomu

Autoři

FAJKUS, Jiří ORCID; Eva SÝKOROVÁ; Kamila NEPLECHOVÁ; Petr DĚDIČ; Marcela ŠEFČÍKOVÁ a Jiří PTÁČEK

Vydání

Vědecké práce VÚB, Havlíčkův Brod, VÚB, 2007, 1802-940X

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00019619

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

PCR; telomere-associated sequences; potato cultivars

Štítky

Změněno: 24. 6. 2008 16:06, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Molecular genotyping techniques are of still increasing importance in agriculture practise and trade. Here we summarize results of research projects in which a novel assay for genotyping of potato cultivars was established. The assay is based on PCR using combinations of primers derived from telomeric and telomere-associated sequences. A high degree of sequence polymorphism and, namely, the variability in mutual arrangement of otherwise conserved sequence-building-blocks of subtelomeres, enabled us to establish a simple and reliable PCR-based assay to distinguish potato cultivars in 2-3 PCR reactions.

Česky

Molekulární techniky zvyšují svoji důležitost v zemědělské praxi i v obchodních vztazích. Sumarizujeme zde výsledky výzkumných projektů, jejichž výsledkem je nový přístup k odlišení genotypů odrůd bramboru. Tato metoda je založena na PCR využívající kombinace primerů navržené v oblasti telomer a telomer asociovaných sekvencí. Vysoký stupeň polymorfismu v těchto oblastech a variabilita v uspořádání konzervativních bloků sekvencí v oblasti subtelomer umožňuje zavedení dostupného a spolehlivého postupu využívajícího PCR, který umožňuje rozlišení odrůd bramboru ve 2 až 3 PCR reakcích

Návaznosti

AV0Z50040507, záměr
Název: Biofyzika dynamických struktur a funkcí biologických systémů
GA521/05/0055, projekt VaV
Název: Molekulární evoluce a funkční analýza komponent rostlinných telomer a telomeráz
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
QC1164, projekt VaV
Název: Charakterizace genotypů bramboru metodou DNA fingerprintingu