2008
Průkaz identity kmenů izolovaných z povrchu zubů a ze zubních kanálků
NOVÁKOVÁ, Dana, Pavel ŠVEC, Martina KUKLETOVÁ, Lenka ŽÁČKOVÁ, Ivo SEDLÁČEK et. al.Základní údaje
Originální název
Průkaz identity kmenů izolovaných z povrchu zubů a ze zubních kanálků
Název anglicky
Identity confirmation of bacterial strains isolated from dental caries and root canals
Autoři
NOVÁKOVÁ, Dana (203 Česká republika, garant), Pavel ŠVEC (203 Česká republika), Martina KUKLETOVÁ (203 Česká republika), Lenka ŽÁČKOVÁ (203 Česká republika) a Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika)
Vydání
2008. vyd. Brno, Mezinárodní seminář SVC, od s. 29-30, 2 s. 2008
Nakladatel
Stomatologické výzkumné centrum
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/08:00026207
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
978-80-210-4596-5
Klíčová slova anglicky
Streptococcus; Lactobacillus; identity confirmation; automatic ribotyping; whole-cell protein analysis
Štítky
Změněno: 1. 7. 2008 07:33, Mgr. Dana Nováková, Ph.D.
V originále
Mikrobiální osídlení zubního plaku a dutiny ústní je pokládáno za významný faktor vzniku a progresi zubního kazu. V průběhu rozvoje zubního kazu hrají důležitou roli bakterie pronikající skrze poškozený zubní povrch do zubní dřeně a kanálků, kde svou metabolickou aktivitou umožňují další šíření kazu. Cílem této práce bylo srovnání výsledků tří typizačních metod a zhodnocení jejich použitelnosti pro průkaz identity bakteriálních izolátů pocházejících ze stejného zubu. Celkem 21 párů streptokoků a laktobacilů (celkem 42 kmenů) izolovaných vždy z povrchu a kanálku totožného zubu u dětských pacientů s diagnózou kazivosti zubů bylo primárně vybráno na základě identického biotypu a výsledků rep-PCR za použití (GTG)5 primeru. Vybrané dvojice byly dále typizovány pomocí analýzy celkových buněčných proteinů a automatické ribotypizace systémem RiboPrinter (DuPont Qualicon). Získané výsledky analýzy proteinů a ribotypizace prokázaly shodně existenci 11 párů identických kmenů. Dvě další dvojice kmenů vykázaly totožné proteinové profily, avšak byly nepatrně odlišeny výsledky ribotypizace, a naopak, pět dvojic se shodnými ribotypy nebyly jednoznačně srovnatelné analýzou celkových buněčných proteinů. Po přihlédnutí k vnitřní metodické chybě obou metod však i tyto odlišné výsledky dovolují spekulovat o totožnosti těchto kmenů. Pouze tři páry izolátů od stejného pacienta byly na základě jednoznačně rozdílného ribotypizačního profilu shledány odlišnými kmeny. Získané výsledky potvrdily možný průnik bakterií z povrchu zubů do zubních kanálků v průběhu progrese zubního kazu a kombinace použitých metod se ukázala jako vhodná pro průkaz identity testovaných kmenů. Studie byla financována v rámci projektu MŠMT č. 1M0528.
Anglicky
A bacterial microflora of dental plaque and oral cavity is considered as an important factor in the formation and progression of dental carries. The bacteria that may penetrate through the damaged dental surface to the dental pulp and roots canal play an important role in a further progress of the dental carries due to their metabolic activity. The aim of this study was evaluation and comparison of three typing methods for typing of bacterial strains retrieved from the dental surface and root of identical teeth. Totally, 21 pairs of streptococci and lactobacilli (in total 42 strains) isolated from dental carries and root canals isolated from early childhood caries affected children were originally chosen based on the identical biotype and the results of rep-PCR fingerprinting with (GTG)5 primer. The selected isolates were additionally typed using whole-cell protein analysis and automatic ribotyping performed by RiboPrinter (DuPont Qualicon). The obtained results of the protein analysis and ribotyping congruently proved 11 strains pairs to be identical. Another two couples of the strains showed identical protein profiles while ribotyping results showed small differences and conversely, five pairs with the same ribotypes were not clearly consistent using the whole-cell protein analysis. Despite these different results and considering reproducibility values of both methods we can conclude that even these slightly different strains could be identical. Only three pairs of isolates retrieved from the same tooth were found as different based on clearly different ribotyping profile. Obtained results confirmed possibility of a penetration of the bacteria through the damaged dental surface to the root canals in a process of dental carries progression. A combination of used methods seems to be suitable for identity confirmation of the tested isolates. The study was supported by project n. 1M0528 of the Ministry of Education of the Czech Republic.
Návaznosti
| 1M0528, projekt VaV |
|