FLASAROVÁ, Magdalena a David ŠMAJS. PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu. In Tomáškovy dny 2008. Sborník abstraktů. 2008.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
Název anglicky PCR detection and subtyping of Treponema pallidum in biological specimens.
Autoři FLASAROVÁ, Magdalena (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant).
Vydání Tomáškovy dny 2008. Sborník abstraktů. 2008.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14110/08:00024818
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Klíčová slova anglicky Treponema pallidum; syphilis; PCR detection; nested PCR; clinical samples
Štítky clinical samples, nested PCR, PCR detection, syphilis, Treponema pallidum
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 26. 6. 2009 14:13.
Anotace
Cílem práce bylo izolovat a detegovat DNA původce syfilis Treponema pallidum poddruhu pallidum z různých typů klinického materiálu od pacientů v různých stádiích syfilis a jednotlivé získané izoláty následně typizovat. Celkem bylo vyšetřeno 333 klinických vzorků od 213 pacientů, z toho 144 sér od 117 pacientů, 72 stěrů od 58 pacientů, 67 sraženin od 61 pacientů, 44 vzorků plné krve od 41 pacientů, 2 tkáně od 2 pacientů, 2 likvory od 2 pacientů a 2 punktáty od 2 pacientů. Celkem bylo vyšetřeno 5 vzorků od 3 novorozenců s kongenotální syfilis. U všech klinických izolátů byla provedena detekce treponemální DNA pomocí dvoukrokové (nested) PCR na gen tmpC (TP0316;kódující membránový lipoprotein) a na gen polA (TP0105;kódující DNA polymerázu 1). Pro typizaci PCR pozitivních klinických vzorků byly amplifikovány části genů TP0136, TP0548, a to primery unikátními pro T. pallidum a vzniklé PCR produkty byly sekvenovány dideoxyterminátorovou metodou.
Anotace anglicky
Detection of the spirochete Treponema pallidum in clinical samples is described and discussed.
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Resortní program výzkumu a vývoje - MZ
VytisknoutZobrazeno: 26. 2. 2020 02:08