a 2008

Quantification of retrotransposon in Festuca pallens population varying in genome size

ŠMERDA, Jakub; Petr ŠMARDA; Lucie HOROVÁ a Petr BUREŠ

Základní údaje

Originální název

Quantification of retrotransposon in Festuca pallens population varying in genome size

Název česky

Kvantifikace retrostransposonů v populaci Festuca pallens s variabilní velikostí genomu

Vydání

The Comparative Biology of Monocotyledons, 2008

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Dánsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00024946

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-87-87772-03-7

Klíčová slova anglicky

Ty1-copia; Ty3-gypsy; quantitative PCR

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 26. 3. 2019 22:16, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.

Anotace

V originále

Variation in genome size found within species and populations offers unique possibility to study ongoing processes of genome size evolution. In a Festuca pallens population with the constant chromosome number we documented recently a high variation in genome size (up to 1.188-fold) that we assume to be a probable consequence of recent retrotransposon activity. Here we tested this hypothesis by studying sequence diversity and copy number of some candidate retrotransposon types in several seedlings with constrasting genome sizes.

Česky

Variation in genome size found within species and populations offers unique possibility to study ongoing processes of genome size evolution. In a Festuca pallens population with the constant chromosome number we documented recently a high variation in genome size (up to 1.188-fold) that we assume to be a probable consequence of recent retrotransposon activity. Here we tested this hypothesis by studying sequence diversity and copy number of some candidate retrotransposon types in several seedlings with constrasting genome sizes.

Návaznosti

GP206/08/P222, projekt VaV
Název: Evoluce GC obsahu a genomu trav
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce GC obsahu a genomu trav
LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase