BROŽKOVÁ, Kristýna, Eva BUDINSKÁ, Pavel BOUCHAL, Lenka HERNYCHOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Dalibor VALÍK, Rostislav VYZULA, Bořivoj VOJTĚŠEK and Rudolf NENUTIL. Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression. Breast Cancer Research. London, Great Britain: Biomed Central Ltd., 2008, vol. 10, No 3, p. R48, 11 pp. ISSN 1465-5411. Available from: https://dx.doi.org/10.1186/bcr2101.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression
Name in Czech Proteinové profilování karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS odhaluje klinickopatologicky relevantní skupiny pacientů stejně jako dříve definované klastry na základě exprese cDNA
Authors BROŽKOVÁ, Kristýna (203 Czech Republic, belonging to the institution), Eva BUDINSKÁ (703 Slovakia, belonging to the institution), Pavel BOUCHAL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Czech Republic), Dana KNOFLÍČKOVÁ (203 Czech Republic), Dalibor VALÍK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Rostislav VYZULA (203 Czech Republic, belonging to the institution), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Czech Republic) and Rudolf NENUTIL (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
Edition Breast Cancer Research, London, Great Britain, Biomed Central Ltd. 2008, 1465-5411.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 30200 3.2 Clinical medicine
Country of publisher United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 5.052
RIV identification code RIV/00216224:14310/08:00028249
Organization unit Faculty of Science
Doi http://dx.doi.org/10.1186/bcr2101
UT WoS 000257869600016
Keywords in English breast cancer; SELDI-TOF MS; cDNA clusters
Tags breast cancer, cDNA clusters, SELDI-TOF MS
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Changed: 1/2/2012 09:55.
Abstract
Microarray-based gene expression profiling represents a major breakthrough for understanding the molecular complexity of breast cancer. cDNA expression profiles cannot detect changes in activities that arise from posttranslational modifications, however, and therefore do not provide a complete picture of all biologically important changes that occur in tumors. Additional opportunities to identify and/or validate molecular signatures of breast carcinomas are provided by proteomic approaches. Surface-enhanced laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF MS) offers high-throughput protein profiling, leading to extraction of protein array data, calling for effective and appropriate use of bioinformatics and statistical tools.
Abstract (in Czech)
Genomové profilování na principu cDNA-microarrays reprezentuje základní nástroj pro pochopení molekulární komplexity rakoviny prsu. cDNA expresní profily nicméně nejsou schopny detekovat změny dané posttranslačními modifikacemi proteinů a neposkytují tedy komplexní obraz všech biologicky významných změn, které nastávají v nádorech. Nové možnosti identifikace a/nebo validace molekulárních změn u karcinomu prstu proto představují proteomické přístupy. Metoda SELDI-TOF MS umožňuje vysoce kapacitní proteinové profilování a poskytuje data "array" typu snadno analyzovatelná pomocí bioinformatických a statistických nástrojů.
Links
MZ0MOU2005, plan (intention)Name: Funkční diagnostika zhoubných nádorů
NR8338, research and development projectName: Funkční analýza drah regulovaných proteinem p53 u nádorů prsu: Integrace genomických a proteomických přístupů zahrnujících techniky DNA-macroarray a hmotnostní spektrometrii na principu SELDI-TOF
PrintDisplayed: 10/5/2024 17:48