J 2007

dCAPS method: advantages, troubles and solution

HRUBÁ, Martina

Základní údaje

Originální název

dCAPS method: advantages, troubles and solution

Autoři

Vydání

Plant, Soil and Environment, Prague, 2007, 1214-1178

Další údaje

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 0.170 v roce 2004

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 1. 7. 2009 18:16, Mgr. Martina Mráčková

Anotace

V originále

In our work, we focus on the evolutionary studies of sex chromosomes. As model organisms we use several species of the plant genus Silene. An important part of our research is represented by genetic mapping based on the assays of DNA length or sequence polymorphisms. Apart from the other methods we also use the dCAPS method, which is very useful for detection of the sequence polymorphisms (SNPs). This method is unique as it is able to detect SNPs that are not situated in any restriction site; a fundamental principle of this method is usage of primer designed with one or two mismatches that bring into the target sequence the mutation in vicinity of SNP. Using this method, we found out some improvements that can make analyses more cost-effective.