J 2009

Integration of on-line protein digestion by trypsin in capillary electrophoresis by means of electrophoretically mediated microanalysis

ZEISBERGEROVÁ, Marta, Andrea ADÁMKOVÁ a Zdeněk GLATZ

Základní údaje

Originální název

Integration of on-line protein digestion by trypsin in capillary electrophoresis by means of electrophoretically mediated microanalysis

Název česky

Integrace tryptického štěpení proteinů do CE pomocí metody EMMA

Autoři

ZEISBERGEROVÁ, Marta (203 Česká republika), Andrea ADÁMKOVÁ (203 Česká republika) a Zdeněk GLATZ (203 Česká republika, garant)

Vydání

Electrophoresis, Weinheim, VHC, 2009, 0173-0835

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.077

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00029144

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000268626900017

Klíčová slova anglicky

Proteomics; Tryptic digestion; Electrophoretically mediated microanalysis; EMMA; Partial filling technique; Sandwich injection

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 9. 4. 2010 10:03, Mgr. Marta Pelcová, Ph.D.

Anotace

V originále

In this work, electrophoretically mediated microanalysis (EMMA) was applied to the in-capillary tryptic digestion of proteins for proteomic purposes. Compared to classical in-solution tryptic digestion or the trypsin reactor commonly used for this purpose, the EMMA based method is rapid, can be automated and requires only small amounts of trypsin and protein preparations. Moreover, the protein digestion and the analysis of the resulting peptides are integrated into one procedure. A combination of the EMMA methodology with a partial filling technique was used in this study, since the pH optimum of the trypsin reaction differs strongly from the best pH for the CE separation of peptides. In this setup, part of the capillary is filled with the best buffer for the tryptic digestion (50 mM Tris-HCl buffer, pH 8.5) whereas the rest of the capillary is filled with the background electrolyte optimal for peptide separation (0.1 M phosphate buffer, pH 2.5).

Česky

Byla vypracována metoda pro integrace tryptického štěpení proteinů do CE pomocí metody EMMA.

Návaznosti

GA203/06/0047, projekt VaV
Název: Využití kapilární elektroforézy pro studium metabolismu léčiv
Investor: Grantová agentura ČR, Využití kapilární elektroforézy pro studium metabolismu léčiv
LC06023, projekt VaV
Název: Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím