J 2008

Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae)

MANDÁKOVÁ, Terezie a Martin LYSÁK

Základní údaje

Originální název

Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae)

Název česky

Evoluce karyotypu u vybraných druhů s počtem chromosomů n=7 z čeledi brukvovitých (Brassicaceae)

Vydání

Plant Cell, United States, AMER SOC PLANT BIOLOGISTS, 2008, 1040-4651

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 9.296

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00024401

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000261378600009

Klíčová slova anglicky

Brassicaceae; comparative chromosome painting (CCP); karyotype evolution; chromosomal phylogeny

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 26. 6. 2009 10:56, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.

Anotace

V originále

Karyotype evolution in species with identical chromosome number but belonging to distinct phylogenetic clades is a longstanding question of plant biology, intractable by conventional cytogenetic techniques. Here, we apply comparative chromosome painting (CCP) to reconstruct karyotype evolution in eight species with x=7 (2n=14, 28) chromosomes from six Brassicaceae tribes. CCPdata allowed us to reconstruct an ancestral Proto-Calepineae Karyotype (PCK; n=7) shared by all x=7 species analyzed. The PCK has been preserved in the tribes Calepineae, Conringieae, and Noccaeeae, whereas karyotypes of Eutremeae, Isatideae, and Sisymbrieae are characterized by an additional translocation. The inferred chromosomal phylogeny provided compelling evidence for a monophyletic origin of the x=7 tribes. Moreover, chromosomal data along with previously published gene phylogenies strongly suggest the PCK to represent an ancestral karyotype of the tribe Brassiceae prior to its tribe-specific whole-genome triplication. As the PCK shares five chromosomes and conserved associations of genomic blocks with the putative Ancestral Crucifer Karyotype (n=8) of crucifer Lineage I, we propose that both karyotypes descended from a common ancestor. A tentative origin of the PCK via chromosome number reduction from n=8 to n=7 is outlined. Comparative chromosome maps of two important model species, Noccaea caerulescens and Thellungiella halophila, and complete karyotypes of two purported autotetraploid Calepineae species (2n=4x=28) were reconstructed by CCP.

Česky

Na základě experimentálních dat získaných metodou komparativního chromosomálního paintingu (KCP) byl zrekonstruován ancestrální Proto-Calepineae Karyotyp (PCK; n=7), který pravděpodobně sdíleli předci analyzovaných druhů se sedmi páry chromosomů (x=7). PCK zůstal zachován u druhů v tribech Calepineae, Conringieae a Noccaeeae, zatímco v karyotypech druhů tribů Eutremeae, Isatideae a Sisymbrieae došlo k sekundárním translokacím. Naše data přesvědčivě dokládají monofyletický původ všech analyzovaných x=7 tribů. Chromosomální data společně s dříve publikovanými fylogenetickými studiemi, naznačují, že PCK představuje také ancestrální karyotyp tribu Brassiceae (druhy rodu Brassica a příbuzné rody). Protože PCK sdílí 5 chromosomů a unikátní asociace genomových bloků s předpokládaným ancestrálním. karyotypem (Ancestral Crucifer Karyotype, ACK; n=8) vývojové linie brukvovitých rostlin -Lineage I, lze předpokládat, že se oba tyto karyotypy vyvinuly ze společného předka.

Návaznosti

KJB601630606, projekt VaV
Název: Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
Investor: Akademie věd ČR, Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací