WIMMEROVÁ, Michaela, Navnit Kumar MISHRA, Martina POKORNÁ a Jaroslav KOČA. Importance of oligomerisation on Pseudomonas aeruginosa Lectin-II binding affinity. In silico and in vitro mutagenesis. Journal of Molecular Modeling. roč. 15, č. 6, s. 673-679. ISSN 1610-2940. 2009.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Importance of oligomerisation on Pseudomonas aeruginosa Lectin-II binding affinity. In silico and in vitro mutagenesis.
Název česky Význam oligomerizace pro vazebnou afinitu lektinu PA-IIL z Pseudomonas aeruginosa. In silico a in vitro mutageneze.
Autoři WIMMEROVÁ, Michaela (203 Česká republika), Navnit Kumar MISHRA (356 Indie), Martina POKORNÁ (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant).
Vydání Journal of Molecular Modeling, 2009, 1610-2940.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.336
Kód RIV RIV/00216224:14310/09:00034730
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000265441900014
Klíčová slova anglicky protein-carbohydrate interaction; computational chemistry
Štítky computational chemistry, protein-carbohydrate interaction
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854. Změněno: 24. 8. 2009 16:05.
Anotace
The effect of terminal GLY114* deletion on the binding affinity of the PA-IIL lectin towards L fucose was investigated. Both experimental (Isothermal Titration Calorimetry) and computational (Molecular dynamics simulations) methods have shown that the deletion mutation decreases the L fucose affinity. It implies that the PA-IIL saccharide binding affinity is influenced by the dimerization of the lectin. A detailed analysis of computational data confirms the key role of electrostatic interactions in the PA-IIL/saccharide binding.
Anotace česky
Byl studován vliv terminální aminokyseliny Gly114 na oligomerizaci a vazebnou afinitu lektinu PA-IIL z Pseudomonas aeruginosa.
Návaznosti
LC06030, projekt VaVNázev: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
ME08008, projekt VaVNázev: Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik, Program výzkumu a vývoje KONTAKT (ME)
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 20. 4. 2024 00:54