J 2009

The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae

LYSÁK, Martin, Marcus A. KOCH, Jeremy M. BEAULIEU, Armin MEISTER, Ilia J. LIETCH et. al.

Základní údaje

Originální název

The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae

Název česky

Dynamicka evoluce genomu u brukvovitých (Brassicaceae)

Autoři

LYSÁK, Martin (203 Česká republika, garant), Marcus A. KOCH (276 Německo), Jeremy M. BEAULIEU (840 Spojené státy), Armin MEISTER (276 Německo) a Ilia J. LIETCH (826 Velká Británie a Severní Irsko)

Vydání

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, USA, OXFORD UNIV PRESS, 2009, 0737-4038

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 9.872

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00028447

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000261681900009

Klíčová slova anglicky

Brassicaceae; Cruciferae; Arabidopsis; genome size evolution; chromosomes; phylogenetics; polyploidy

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 26. 6. 2009 10:53, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.

Anotace

V originále

This paper reports new genome size (GS) data for more than 100 cruciferous species in addition to previously published C-values to give a data set comprising 185 Brassicaceae taxa. Evolution of GS was analyzed within a phylogenetic framework. Approximately 50% of crucifer taxa analyzed showed a decrease in GS compared with the ancestral genome size inferred for Brassicaceae. The remaining species showed an increase in GS although this was generally moderate. We also found that GS has not changed substantially through time and most likely evolves passively. It is suggested that mechanisms to suppress amplification and to eliminate amplified DNA must be active in Brassicaceae.

Česky

Tato práce přináší nové hodnoty velikosti genomu pro více než 100 druhů brukvovitých, které společně s už publikovanými C- hodnotami představují údaje o velikosti genomu pro 185 druhů brukvovitých. Evoluce velikosti genomu byla analyzována v kontextu molekulárně fylogenetických rekonstrukcí. Přibližně 50% analyzovaných druhů vykázalo zmenšení velikosti genomu v porovnání s ancestrální velikostí genomu brukvovitých. Zbývající druhy vykázaly vzrůst velikosti genomu, ačkoliv ten byl obecně jen mírný. Bylo také zjištěno, že velikost genomu se během evolučního času měnila pravděpodobně jen pasivně. Je možné se domnívat, že v čeledi Brassicaceae existují aktivní mechanismy inhibující amplifikaci (repetitivní) DNA nebo tuto DNA eliminující.

Návaznosti

KJB601630606, projekt VaV
Název: Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
Investor: Akademie věd ČR, Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací