2008
Acquiarium version 1.6
MATULA, Pavel, Ondřej DANĚK, Martin MAŠKA a Marek VINKLERZákladní údaje
Originální název
Acquiarium version 1.6
Název česky
Acquiarium verze 1.6
Autoři
MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Ondřej DANĚK (203 Česká republika, domácí), Martin MAŠKA (203 Česká republika, domácí) a Marek VINKLER (203 Česká republika, domácí)
Vydání
2008
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Software
Obor
20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Kód RIV
RIV/00216224:14330/08:00027695
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
Klíčová slova anglicky
image acquisition; image correction; automated image analysis; fluorescence microscopy
Technické parametry
free software distributed as binaries; written in C++ language, version 1.6
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 27. 11. 2015 08:08, RNDr. Marek Vinkler, Ph.D.
V originále
Acquiarium 1.6 is free software for solving the common pipeline of many spatial cell studies using fluorescence microscopy. It addresses image capture, raw image correction, image segmentation, quantification of segmented objects and their spatial arrangement, volume rendering, and statistical evaluation. The software is designed for processing of a collection of many 3D images. It can be used for analysis of a collection of 2D images or time lapse series of 2D or 3D images as well. It has a modular design and is extensible via plug-ins.
Česky
Acquiarium 1.6 je volně šiřitelný software pro provádění prostorových studií na buňkách pomocí fluorescenční mikroskopie. Software řeší snímání obrazu, korekce nasnímaných dat, segmentaci obrazu, kvantifikaci segmentovaných objektů a jejich prostorového rozložení, objemové vizualizace a statistické vyhodnocení. Software je navržen pro zpracování kolekce mnoha 3D obrazů. Může však být použit i pro analýzu kolekce 2D obrazů, nebo časových sérií 2D nebo 3D obrazů. Software je modulární a rozšiřitelný pomocí zásuvných modulů.
Návaznosti
| 2B06052, projekt VaV |
|