2009
Identifikace genů rezistence k padlí travnímu u planého ječmene Hordeum vulgare ssp. spontaneum PI391126
SOLDÁNOVÁ, Martina; Jana ŘEPKOVÁ; Pavel LÍZAL a Antonín DREISEITLZákladní údaje
Originální název
Identifikace genů rezistence k padlí travnímu u planého ječmene Hordeum vulgare ssp. spontaneum PI391126
Název anglicky
Identification of powdery mildew resistance genes in wild barley (Hordeum vulgare ssp. spontaneum)
Autoři
SOLDÁNOVÁ, Martina; Jana ŘEPKOVÁ; Pavel LÍZAL a Antonín DREISEITL
Vydání
Brno, XIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, od s. 91-92, 111 s. 2009
Nakladatel
978-80-210-4830-0
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
tištěná verze "print"
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00035393
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
978-80-210-4830-0
Klíčová slova česky
mapování; SSR; padlí travní; Blumeria graminis
Klíčová slova anglicky
mapping; SSR; powdery mildew; Blumeria graminis
Štítky
Změněno: 25. 3. 2013 14:46, prof. RNDr. Jana Řepková, CSc.
V originále
Cílem práce bylo využití planého ječmene PI391126 získaného z genové banky USDA k identifikaci účinných genů odolnosti k padlí travnímu. S tímto cílem bylo provedeno křížení náchylné odrůdy Tiffany s PI391126, získaná generace F1 byla zdrojem pro analyzovanou populaci F2. Pro zjištění počtu genů rezistence a typu dědičnosti byly testované rostliny parentální, F1 a F2 generace inokulovány virulentním patotypem (Va7) 4523. Reakční typy (RT) rostlin byly odečítány podle devítibodové stupnice 0-4, včetně intertypů. V populaci generace F2 bylo zjištěno 234 odolných a 6 náchylných rostlin. Testem chí-kvadrát (1,37) byl potvrzen štěpný poměr 63:1 a byla tak stanovena přítomnost tří genů odolnosti s dominantní dědičností. Fenotypové hodnocení generace F1 ukázalo na neúplně dominantní dědičnost. K identifikaci genů bylo využito genetické mapování v populaci F2, kterou tvořilo celkem 124 rostlin. Jako DNA markery byly použity mikrosatelity (SSR - Simple Sequence Repeat). Dále byly navrženy primery (program Primer3) pro nové markery odvozené ze sekvence genu RGH1a (Resistance Gene Homologue 1a; databáze NCBI) z lokusu Mla. Vazba mezi markery a geny odolnosti byla identifikována pomocí dvou bulků rostlin, a to 19 odolných (RT 0) a 18 náchylných (RT 3-4 a 4) rostlin generace F2. Pomocí nich byla zjištěna genetická vazba s markery GBM1007, Bmac0213, UMB503 a RGH1aE2a na chromozomu 1H, GBMS247, Bmac0134, GBM1281, GBM1121 a Bmag0692 na chromozomu 2H a Bmag0225 na chromozomu 3H. Marker RGH1aE2a a Bmag0225 nevykazovali na rozdíl od ostatních kodominantní charakter. Mapováním pomocí všech rostlin F2 byla potvrzena statisticky významná vazba u GBM1007 (LOD = 5,15) na chromozomu 1H a u Bmac0134 (LOD = 2,8) na chromozomu 2H. Pro třetí gen nebyla prozatím potvrzena statisticky významná vazba s žádným DNA markerem.
Anglicky
The aim of study was used wild barley (Hordeum vulgare ssp. Spontaneum, PI391126) to identification of resistance genes to powdery mildew. The genetic and the molecular analyses were performed in the F2 population of the cross between the cultivar Tiffany and the resistant PI391126. According to the ratio of resistant (234) and susceptible (6) F2 plants scored after resistance test, in the accession PI391126 resistance is determined by three genes with dominant type of inheritance, one of the genes being in the Mla locus. To the genetic mapping was used the data from 124 F2 plants of all genotypes. As DNA markers were employed the microsatellites (SSR - Simple Sequence Repeat) and the primers derived from RGH1a semence. The significant genetic linkage was found in the marker GBM1007 (LOD = 5,15) on chromosome 1H and in the marker Bmac0134 (LOD = 2,8) on chromosome 2H. The linkage of third gene was not significant.
Návaznosti
| MSM0021622415, záměr |
|