CALCITE MOONMILK AND ITS BACTERIAL ASSOCIATION

KOSINA, Marcel, Andrea TESHIM, Eva NĚMCOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Ondrej ŠEDO a Matej LEXA. CALCITE MOONMILK AND ITS BACTERIAL ASSOCIATION. In 17th INTERNATIONAL KARSTOLOGICAL SCHOOL "CLASSICAL KARST" CAVE CLIMATE. 2009.

Základní údaje

Originální název

CALCITE MOONMILK AND ITS BACTERIAL ASSOCIATION

Název česky

NICKAMÍNEK A JEHO BAKTERIÁLNÍ SPOLEČENSTVÍ

Autoři

KOSINA, Marcel (203 Česká republika, garant), Andrea TESHIM (203 Česká republika), Eva NĚMCOVÁ (203 Česká republika), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika) a Matej LEXA (703 Slovensko)

Vydání

17th INTERNATIONAL KARSTOLOGICAL SCHOOL "CLASSICAL KARST" CAVE CLIMATE, 2009

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Slovinsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00035818

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

moonmilk; bacteria; Pseudomonas; polyphasic approach; ribotyping; MALDI-MS TOF; SDS-PAGE; 16S rDNA

Štítky

16S rDNA, bacteria, MALDI-MS TOF, moonmilk, polyphasic approach, Pseudomonas, ribotyping, SDS-PAGE

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

Caves are considered to be an extreme environment for life. However, closer investigation might reveal that life in caves can be unexpectedly various. Calcite moonmilk, a secondary cave deposit was examined for bacterial component in our study. The origin of this material is still discussed although earlier works showed occurence of microorganisms and the possibility of their influence on formation of moonmilk. Active or passive role of microbiota is still unclear. The aim of our work was to characterize isolated bacterial strains by using a polyphasic taxonomic approach and also find an equivalence of bacterial phenotypic characteristics according to a place of sampling. Moonmilk was sampled in caves of The Moravian Karst, Czech Republic and also in caves in Slovakia. 82 bacterial strains were isolated from the moonmilk samples on four different media. The samples were aerobically cultivated at 10 and 15 degrees of Celsia. The isolated psychrotrophic bacterial strains were characterized by biochemical, physiological tests and whole-cell protein analysis by SDS-PAGE. Selected group of strains was also characterized by ribotyping and MALDI-MS TOF. Partial 16S rRNA gene sequencing was performed on 10 gram-negative strains and followed by sequence alignment analysis with the GenBank BLAST program. Only two isolates represented gram-positive rods and the rest of strains were gram-negative non-fermenting rods. The majority of them were classified as fluorescent pseudomonads with some atypical biochemical properties. Phenotypic characteristics of some strains even showed equivalence among distant places of sampling.

Česky

Jeskyně jsou považovány za extrémní prostředí pro život. Avšak detailnější výzkumy odhalují, že život v jeskyních může být neočekávaně pestrý. Nickamínek tvořený uhličitanem vápenatým byl podroben mikrobiologickému rozboru. Původ této speleotémy je stále nejasný, ačkoliv dřívější práce potvrzují přítomnost mikroorganismů a naznačují možnost jejich vlivu na utváření nickamínku. Cílem této práce bylo izolovat bakteriální kmeny z nickamínku a následně aplikovat polyfázový taxonomický přístup a najít možné souvislosti mezi místy odběru..

---

Návaznosti

MSM0021622416, záměr

Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase