Unraveling the mesopolyploid history of Australian crucifers (Brassicaceae)

MANDÁKOVÁ, Terezie a Martin LYSÁK. Unraveling the mesopolyploid history of Australian crucifers (Brassicaceae). In Polyploidy, Hybridization and Biodiversity. 2009.

Základní údaje

• Originální název: Unraveling the mesopolyploid history of Australian crucifers (Brassicaceae)
• Název česky: Mesopolyploidie u australských endemických rostlin z čeledi brukvovitých (Brassicaceae)
• Autoři: MANDÁKOVÁ, Terezie (203 Česká republika) a Martin LYSÁK (203 Česká republika, garant).
• Vydání: Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, 2009.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Francie
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/09:00028533
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• UT WoS: 000269055300106
• Klíčová slova anglicky: Polyploidy; Australian crucifers; comparative chromosome painting
• Štítky: Australian crucifers, comparative chromosome painting, polyploidy

Anotace

The lowest chromosome numbers known in Brassicaceae (n=4-6) can be found in endemic Australian cruciferous species closely related to the model species Arabidopsis thaliana. We aimed to reconstruct the modes of chromosome number reduction in the Australian taxa from a tentative Ancestral Crucifer Karyotype (ACK, n=8) by comparative chromosome painting (CCP). In three Australian cruciferous species, Stenopetalum nutans (2n=8), Arabidella eremigena (2n=10) and Ballantinia antipoda (2n=12), all 24 genomic blocks of the ACK were unexpectedly found in duplicates. These data suggest that all three species experienced a relatively recent whole-genome duplication followed by massive karyotype reshuffling and chromosome fusions. The unique associations of ancestral genomic blocks shared by the ACK and the Australian crucifers suggest that the reduced crucifer karyotypes (n=4-6) descended from the ACK (n=8) via a polyploid ancestor with yet unknown chromosome number.

Anotace česky

Nejnižší chromosomální počty v čeledi Brassicaceae (n=4-6) se nacházejí u australských endemitů blízce příbuzných modelovému druhu Arabidopsis thaliana. Naším cílem bylo rekonstruovat způsoby a mechanismy redukce chromosomálního počtu vybraných australských druhů z ancestraálního karyotypu čeledi brukvovitých (ACK, n=8) pomocí metody komparativního chromosomálního paintingu (CCP). U tří studovaných druhů, Stenopetalum nutans (2n=8), Arabidella eremigena (2n=10) a Ballantinia antipoda bylo všech 24 genomických bloků ACK nalezeno ve dvou kopiích. Tato data naznačují, že studované druhy prodělaly relativně nedávnou duplikaci celého genomu, která byla následována masivními přestavbami karyotypu a chromosomálními fúzemi. Unikátní asociace ancestrálních genomických bloků sdílených mezi ACK a studovanými australskými druhy podporují teorii, podle které tyto redukované brukvovité karyotypy (n=4-6) vznikly z ACK (n=8) prostřednictvím polyploiodního ancestrora s dosud neznámým chromosomových počtem.

Návaznosti

• IAA601630902, projekt VaV: Název: Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu

Investor: Akademie věd ČR, Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací