a 2009

Large-Scale Free Energy Calculations as Showcase of Worldwide Grid Usability

STŘELCOVÁ, Zora; Petr KULHÁNEK; Jan KMUNÍČEK; Jaroslav KOČA; Luděk MATYSKA et al.

Základní údaje

Originální název

Large-Scale Free Energy Calculations as Showcase of Worldwide Grid Usability

Název česky

Large-Scale Free Energy Calculations as Showcase of Worldwide Grid Usability

Autoři

STŘELCOVÁ, Zora; Petr KULHÁNEK; Jan KMUNÍČEK; Jaroslav KOČA a Luděk MATYSKA

Vydání

4th EGEE User Forum/OGF 25 and OGF Europe's 2nd International Event, 2009

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

voce;charon;volna energie; supramolekularni chemie; pseudorotaxany

Klíčová slova anglicky

voce;charon;free energy;multiple walker approach;adaptive biasing force method;supramolecular chemistry;pseudorotaxanes

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 10. 4. 2010 11:11, prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.

Anotace

ORIG CZ

V originále

In biochemical or chemical disciplines, the free energy forms a basis for the assessment of theoretical models towards experimental data. Unfortunately, its calculation is still very time consuming task. Recently, we have implemented and tested the multiple walker approach, which significantly accelerates such kind of calculations, in a cluster environment. Since this approach requires only small communication overhead, we would like to extend and test it in a grid environment too.

Česky

In biochemical or chemical disciplines, the free energy forms a basis for the assessment of theoretical models towards experimental data. Unfortunately, its calculation is still very time consuming task. Recently, we have implemented and tested the multiple walker approach, which significantly accelerates such kind of calculations, in a cluster environment. Since this approach requires only small communication overhead, we would like to extend and test it in a grid environment too.

Návaznosti

LC06030, projekt VaV
Název: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM6383917201, záměr
Název: Optická síť národního výzkumu a její nové aplikace