R 2008

CAVER 2.0

MEDEK, Petr; Petr BENEŠ; Barbora KOZLÍKOVÁ; Eva CHOVANCOVÁ; Antonín PAVELKA et al.

Základní údaje

Originální název

CAVER 2.0

Název česky

CAVER 2.0

Autoři

MEDEK, Petr; Petr BENEŠ; Barbora KOZLÍKOVÁ ORCID; Eva CHOVANCOVÁ; Antonín PAVELKA; Tibor SZABÓ; Matúš ZAMBORSKÝ; Filip ANDRES; Martin KLVAŇA; Jan BREZOVSKÝ; Jiří SOCHOR a Jiří DAMBORSKÝ

Vydání

2008

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00024501

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

tunel výpočet

Klíčová slova anglicky

tunnel calculation

Technické parametry

computer program

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 2. 7. 2009 11:27, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Anotace

V originále

CAVER provides rapid, accurate and fully automated calculation of pathways leading from buried cavities to outside solvent in protein structures. Study of these pathways is important in drug design and molecular enzymology. CAVER facilitates analysis of any molecular structure including proteins, nucleic acids, inorganic materials, and is available as online version or PyMOL plugin. CAVER Viewer enables efficient visualization of calculated pathways and can be run online using Java Web Start technology.

Česky

CAVER poskytuje rychlý a přesný výpočet tunelů v proteinech.

Návaznosti

GA201/07/0927, projekt VaV
Název: Vizualizace proteinových struktur
Investor: Grantová agentura ČR, Vizualice proteinových struktur
IAA100040602, projekt VaV
Název: Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace.
Investor: Akademie věd ČR, Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace
LC06010, projekt VaV
Název: Centrum biokatalýzy a biotransformací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biokatalýzy a biotransformací
MSM0021622412, záměr
Název: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni