a 2009

Comparison of five PCR methods for characterization of Streptococcus mutans

ŠVEC, Pavel, Dana NOVÁKOVÁ, Martina KUKLETOVÁ a Ivo SEDLÁČEK

Základní údaje

Originální název

Comparison of five PCR methods for characterization of Streptococcus mutans

Název česky

Srovnání pěti PCR metod pro typizaci Streptococcus mutans

Autoři

ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant), Dana NOVÁKOVÁ (203 Česká republika), Martina KUKLETOVÁ (203 Česká republika) a Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika)

Vydání

3st FEMS Congress of European Microbiologists (FEMS 2009), 2009

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Švédsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00029411

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

Streptococcus mutans; RAPD-PCR; rep-PCR; taxonomie

Klíčová slova anglicky

Streptococcus mutans; RAPD-PCR; rep-PCR; taxonomy

Štítky

Změněno: 10. 7. 2009 11:22, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Streptococcus mutans attracts great interest of oral clinical microbiologists because it plays a crucial role in the development of dental caries. Development and evaluation of easy to perform, fast and reliable typing methods is important in all clinical studies. RAPD-PCR with M13 primer as well as rep-PCRs with ERIC, REP, BOX and (GTG)5 primers were performed according to the PCR protocols described previously. All S. mutans strains were typeable by M13 primer and revealed 26 fingerprints ranging from 3 000 to 350 bp. Rep-PCR reactions with ERIC, REP and BOX primers revealed only a few very week or none DNA products; in contrast to these results rep-PCR with the (GTG)5 primer showed 24 fingerprints ranging from 3500 to 200 bp. The (GTG)5-PCR method revealed more complex fingerprints than RAPD-PCR. The clustering revealed by both methods was different and showed comparable discriminative power. The study was supported by projects GACR 310/09/0657 and 1M0528.

Česky

Práce popisuje výsledky typizace kmenů S. mutans s vyuzitím RAPD-PCR s primerem M13 a rep-PCR metod s primery ERIC, REP, BOX a (GTG)5.

Návaznosti

GA310/09/0657, projekt VaV
Název: Molekulární taxonomie grampozitivních bakterií izolovaných ze zubního kazu v dočasné dentici
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární taxonomie grampozitivních bakterií izolovaných ze zubního kazu v dočasné dentici
1M0528, projekt VaV
Název: Stomatologické výzkumné centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Stomatologické výzkumné centrum