Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of
pyrimidine residues modification by osmium tetroxide,
2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines
in DNA heteroduplexes.

D 2009

Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of pyrimidine residues modification by osmium tetroxide, 2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines in DNA heteroduplexes.

FOJTA, Miroslav, Pavel KOSTEČKA, Miroslava BITTOVÁ, Martin BARTOŠÍK, Tibor HIANIK et. al.

Základní údaje

Originální název

Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of pyrimidine residues modification by osmium tetroxide, 2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines in DNA heteroduplexes.

Název česky

Elektrochemická a elektroforetická studie pyrimidinových zbytků modifikovaných OsO4, bipy. Detekce nespárovaných a chybně spárovaných thyminů v heteroduplexech DNA

Autoři

FOJTA, Miroslav (203 Česká republika), Pavel KOSTEČKA (203 Česká republika), Miroslava BITTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Martin BARTOŠÍK (203 Česká republika), Tibor HIANIK (703 Slovensko), Libuše TRNKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Emil PALEČEK (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Ústí nad Labem, XXIX. moderní elektrochemické metody - sborník příspěvků, 2 s. 2009

Nakladatel

BEST servis

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00036238

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-86238-39-5

Klíčová slova anglicky

DNA; OsO4 bipy; voltammetry; capillary electrophoresis

Štítky

Capillary electrophoresis, DNA, OsO4 bipy, Voltammetry

Změněno: 18. 1. 2013 19:51, Mgr. Miroslava Bittová, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

In this work we used capillary zone electrophoresis (CZE) in combination with square wave voltammetry (SWV) at a pyrolytic graphite electrode (PGE) to study reactivity of different pyrimidine residues, thymine (T), uracil (U), cytosine (C) and 5 methyl cytosine (meC), within a pentanucleotide AAAAY (where Y stands for the pyrimidine residue), towards Os,bipy. Since adenine practically does not react with Os,L, Y residues represent the only reactive centre within the pentamers and their reactivity can thus be easily compared. Both techniques revealed the order of the Y reactivities as follows: T>>MeC~U>C. Hence, our results confirmed (a) highly preferential modification of T among all Ys and (b) increased reactivity of MeC, compared to C that was reported by other authors. However, despite recent papers presenting Os,L modification as useful tool for MeC detection in DNA, the strong modification of T within natural DNA (where T is much more abundant than MeC) makes this approach hardly applicable for real analyses of DNA methylation.

Česky

V této práci jsme studovali reaktivitu pyrimidinových derivátů (thymin, uracil, 5 methyluracil, cytosin) a OsO4,bipy pomocí voltametrie a kapilární zónové elektroforézy.

Návaznosti

LC06035, projekt VaV

Název: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu

Citovat

FOJTA, Miroslav, Pavel KOSTEČKA, Miroslava BITTOVÁ, Martin BARTOŠÍK, Tibor HIANIK, Libuše TRNKOVÁ a Emil PALEČEK. Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of pyrimidine residues modification by osmium tetroxide, 2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines in DNA heteroduplexes. In XXIX. moderní elektrochemické metody - sborník příspěvků. Ústí nad Labem: BEST servis, 2009, 2 s. ISBN 978-80-86238-39-5.

@inproceedings{840518,
   author = {Fojta, Miroslav and Kostečka, Pavel and Bittová, Miroslava and Bartošík, Martin and Hianik, Tibor and Trnková, Libuše and Paleček, Emil},
   address = {Ústí nad Labem},
   booktitle = {XXIX. moderní elektrochemické metody - sborník příspěvků},
   keywords = {DNA; OsO4 bipy; voltammetry; capillary electrophoresis},
   howpublished = {tištěná verze "print"},
   language = {eng},
   location = {Ústí nad Labem},
   isbn = {978-80-86238-39-5},
   publisher = {BEST servis},
   title = {Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of pyrimidine residues modification by osmium tetroxide, 2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines in DNA heteroduplexes.},
   year = {2009}
}

TY  - JOUR
ID  - 840518
AU  - Fojta, Miroslav - Kostečka, Pavel - Bittová, Miroslava - Bartošík, Martin - Hianik, Tibor - Trnková, Libuše - Paleček, Emil
PY  - 2009
TI  - Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of pyrimidine residues modification by osmium tetroxide, 2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines in DNA heteroduplexes.
PB  - BEST servis
CY  - Ústí nad Labem
SN  - 9788086238395
KW  - DNA
KW  - OsO4 bipy
KW  - voltammetry
KW  - capillary electrophoresis
N2  - In this work we used capillary zone electrophoresis (CZE) in combination with square wave voltammetry (SWV) at a pyrolytic graphite electrode (PGE) to study reactivity of different pyrimidine residues, thymine (T), uracil (U), cytosine (C) and 5 methyl cytosine (meC), within a pentanucleotide AAAAY (where Y stands for the pyrimidine residue), towards Os,bipy. Since adenine practically does not react with Os,L, Y residues represent the only reactive centre within the pentamers and their reactivity can thus be easily compared. Both techniques revealed the order of the Y reactivities as follows: T>>MeC~U>C. Hence, our results confirmed (a) highly preferential modification of T among all Ys and (b) increased reactivity of MeC, compared to C that was reported by other authors. However, despite recent papers presenting Os,L modification as useful tool for MeC detection in DNA, the strong modification of T within natural DNA (where T is much more abundant than MeC) makes this approach hardly applicable for real analyses of DNA methylation.
ER  -

FOJTA, Miroslav, Pavel KOSTEČKA, Miroslava BITTOVÁ, Martin BARTOŠÍK, Tibor HIANIK, Libuše TRNKOVÁ a Emil PALEČEK. Electrochemical and capillary zone electrophoresis study of pyrimidine residues modification by osmium tetroxide, 2,2´-bipyridine. Detection of unpaired and mispaired thymines in DNA heteroduplexes. In \textit{XXIX. moderní elektrochemické metody - sborník příspěvků}. Ústí nad Labem: BEST servis, 2009, 2 s. ISBN~978-80-86238-39-5.

Podrobný výpis o publikaci