BARNAT, Jiří, Luboš BRIM, Ivana ČERNÁ, Sven DRAŽAN, Jana FABRIKOVÁ, Jan LÁNÍK a David ŠAFRÁNEK. BioDiVinE: A Tool for Parallel Analysis of Multi-Affine ODE Models. In Computational Mehotds in Systems Biology: Abstract of the Posters. Pisa: University of Pisa, 2009, s. 1-5, 4 s.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název BioDiVinE: A Tool for Parallel Analysis of Multi-Affine ODE Models
Název česky BioDiVinE: Nástroj pro paralelní analýzu multi-afinních ODE modelů
Autoři BARNAT, Jiří, Luboš BRIM, Ivana ČERNÁ, Sven DRAŽAN, Jana FABRIKOVÁ, Jan LÁNÍK a David ŠAFRÁNEK.
Vydání Pisa, Computational Mehotds in Systems Biology: Abstract of the Posters, od s. 1-5, 4 s. 2009.
Nakladatel University of Pisa
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Klíčová slova anglicky parallel model checking; ordinary differential equations; multi-affine systems
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., učo 197. Změněno: 17. 12. 2010 11:15.
Anotace
This work focuses on analysis of dynamic systems describing functionality of biological networks. In particular, the biological model is considered as a system of multi-affine ODEs. The continuous state space of the dynamic system is abstracted into a finite automaton by employing the rectangular abstraction method. The analysis is performed on abstracted models. In particular, the state space reachable from given initial conditions (initial concentration of species) is automatically generated and analysed.
Anotace česky
Článek se zaměřuje na analýzu dynamických systémů popisujících chování biologických sítí. Biologický model je chápán ve formě multi-afinního systému diferenciálních rovnic. Spojitý stavový prostor je abstrahován prostřednictvím konečné obdélníkové abstrakce. Nad konečnou abstrakcí je prováděna analýza metodou model checking.
Návaznosti
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
1ET408050503, projekt VaVNázev: Techniky automatické verifikace a validace softwarových a hardwarových systémů
Investor: Akademie věd ČR, Techniky automatické verifikace a validace softwarových a hardwarových systémů
VytisknoutZobrazeno: 10. 7. 2024 02:17