STRAŠÁK, Luděk, Eva BÁRTOVÁ, Andrea HARNIČAROVÁ, Gabriela GALIOVÁ, Jana KREJČÍ a Stanislav KOZUBEK. H3K9 Acetylation and Radial Chromatin Positioning. Journal of cellular physiology. United States: Wiley-Liss, 2009, roč. 220, č. 1, s. 91-101. ISSN 0021-9541.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název H3K9 Acetylation and Radial Chromatin Positioning
Název česky H3K9 acetylace a radiální chromatinové uspořádání
Autoři STRAŠÁK, Luděk (203 Česká republika), Eva BÁRTOVÁ (203 Česká republika), Andrea HARNIČAROVÁ (703 Slovensko), Gabriela GALIOVÁ (203 Česká republika), Jana KREJČÍ (203 Česká republika) a Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika, garant).
Vydání Journal of cellular physiology, United States, Wiley-Liss, 2009, 0021-9541.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 4.586
Kód RIV RIV/00216224:14310/09:00028664
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000266672400011
Klíčová slova česky epigenetika; HDACi
Klíčová slova anglicky HDACi; epigenetics
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Anna Potáčová, Ph.D., učo 44190. Změněno: 1. 4. 2010 17:03.
Anotace
We analyzed the effect of epigenetic changes induced by a histone deacetylase inhibitor (HDACi) on the nuclear radial rearrangement of select genomic regions and chromosomes. Three-dimensional analysis of nuclear radial distributions revealed that this increase in H3K9 acetylation was often associated with a repositioning of select loci and chromosomes toward the nuclear center. On the other hand, many centromeres resided sites more toward the nuclear periphery, similar to sites occupied by chromosome X. In more than two-thirds of events analyzed, central nuclear positioning correlated with a high level of H3K9 acetylation, while more peripheral positioning within interphase nuclei correlated with a lower level of acetylation. This was observed for the gene-rich chromosomes 17 and 19, TP53, and CCND / genes as well as for gene-poor chromosome 18, APC gene, regions of low transcriptional activity (anti-RIDGEs), and the relatively transcriptionally less active chromosome X.
Anotace česky
Analyzovali jsme efekt epigenetických změn indukovaných inhibitorem histon deacetylázy na jadernou reorganizaci vybraných genomických úseků a chromozómů. U více než 2/3 případů centrální lokalizace jádra korelovala se zvýšenou hladinou acetylace H3K9, zatímco periferní lokalizace v interfázním nuclei koreluje s nízkou acetylací. Toto bylo pozorováno u chromozómů 17, 19, TP53 a CCND i u chromozomu 18 a APC genu.
Návaznosti
IAA5004306, projekt VaVNázev: Struktura lidského genomu
Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu
LC06027, projekt VaVNázev: Univerzitní výzkumné centrum - Česká myelomová skupina (Akronym: LC MGUS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Univerzitní výzkumné centrum - Česká myelomová skupina (URC - CMG)
LC535, projekt VaVNázev: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
VytisknoutZobrazeno: 10. 7. 2024 14:46