D 2009

Deciphering the lectin code by means of molecular modelling correlated with structure-functional experimental studies

ADAM, Jan; Zdeněk KŘÍŽ; Martin PROKOP; Michaela WIMMEROVÁ; Jaroslav KOČA et al.

Základní údaje

Originální název

Deciphering the lectin code by means of molecular modelling correlated with structure-functional experimental studies

Název česky

Deciphering the lectin code by means of molecular modelling correlated with structure-functional experimental studies

Autoři

ADAM, Jan; Zdeněk KŘÍŽ; Martin PROKOP; Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA

Vydání

Brno, XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, s. 3-3, 2009

Nakladatel

Masarykova Univerzita

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-210-4830-0

Klíčová slova česky

molecular modelling; docking; lectin engineering

Klíčová slova anglicky

molecular modelling; docking; lectin engineering
Změněno: 9. 4. 2010 09:16, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Anotace

V originále

The current computational capacity allows to perform sophisticated simulations and modelling of complicated, yet, for the living organisms essential processes - the biomolecular interactions Lectins are proteins capable of binding saccharide structures with both high affinity and specificity. Several types of molecular modeling applications were combined into a robust method of prediction of the binding behavior of several lectins. The method was tested and validated against the experimental results , and recently, the identification of possible mutations favourable for shifting the binding preferences in desired directions is underway. Besides the protein engineering, the molecular modeling also offered new insights and possible explanations of the molecule behavior in situations where experimental data are not available yet. The use of molecular modeling for in silico predictions can greatly help to increase the efficiency of the whole biomolecular research.

Česky

Kombinaci nekolika dostupnych prostredku vypocetni chemie a molekuloveho modelovani byla vyvinuta metoda, kterou je mozno vyuzit k in silico modelovani chovani lektin-sacharidoveho systemu v zavislosti na provedenych mutacich. Pouzitim teto metody je mozno usetrit experimentalni cas diky casove nepomerne mensim narokum na urceni potencialne slibnych mutaci in silico.

Návaznosti

LC06030, projekt VaV
Název: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím