2009
Modified TWINSPAN classification in which the hierarchy respects cluster heterogeneity
ROLEČEK, Jan; Lubomír TICHÝ; David ZELENÝ a Milan CHYTRÝZákladní údaje
Originální název
Modified TWINSPAN classification in which the hierarchy respects cluster heterogeneity
Název česky
Modifikovaná klasifikace pomocí TWINSPANu, ve které hierarchie respektuje heterogenitu skupin
Autoři
Vydání
Journal of Vegetation Science, Uppsala, Opulus Press, 2009, 1100-9233
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 2.376
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00028700
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000267755000003
Klíčová slova česky
korespondenční analýza; heterogenita datového souboru; míry nepodobnosti; divizivní klasifikace; míry heterogenity; hierarchická klasifikace; numerická klasifikace; rostlinné společenstvo; kalsifikace vegetace
Klíčová slova anglicky
Compositional data analysis; Correspondence analysis; Dataset heterogeneity; Dissimilarity measures; Divisive classification; Heterogeneity measures; Hierarchical classification; Numerical classification; Plant community; Vegetation classification
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 23. 9. 2012 13:29, prof. RNDr. Milan Chytrý, Ph.D.
V originále
Aim To propose a modification of the TWINSPAN algorithm that enables production of divisive classifications that better respect the structure of the data. Methods The proposed modification combines the classical TWINSPAN algorithm with analysis of heterogeneity of the clusters prior to each division. Four different heterogeneity measures are involved: Whittaker's beta, total inertia, average S circle divide rensen dissimilarity and average Jaccard dissimilarity. Their performance was evaluated using empirical vegetation datasets with different numbers of plots and different levels of heterogeneity. Results While the classical TWINSPAN algorithm divides each cluster coming from the previous division step, the modified algorithm divides only the most heterogeneous cluster in each step. The four tested heterogeneity measures may produce identical or very similar results. However, average Jaccard and S circle divide rensen dissimilarities may reach extreme values in clusters of small size and may produce classifications with a highly unbalanced cluster size. Conclusions The proposed modification does not alter the logic of the TWINSPAN classification, but it may change the hierarchy of divisions in the final classification. Thus, unsubstantiated divisions of homogeneous clusters are prevented, and classifications with any number of terminal clusters can be created, which increases the flexibility of TWINSPAN.
Česky
Cíl: Navrhnout modifikaci algoritmu TWINSPAN, který umožní tvorbu divizivní klasifikace s úplnou hierarchií jednotlivých částí stromu. Metodika: Navržená modifikace kombinuje známý algoritmus TWINSPANu s analýzou heterogeneity klastrů po každém dělení. Byly testovány čtyři různé míry heterogeneity. Jejich efektivita byla ověřena na reálných datových douborech. Výsledky: Zatímco původní algoritmus TWINSPANu dělí každý klastr předcházejícího dělení, modifikovaný TWINSPAN dělí v každém kroku jen nejvíce heterogenní klastr. Závěry: Navržená modifikace nemění logiku původního TWINSPANu, ale umožňuje plně hierarchickou divizivní klasifikaci.
Návaznosti
| KJB601630504, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622416, záměr |
|