a 2009

C-13 Chemical Shifts – Structure Relationships In Nucleic Acids

NOVÁK, Petr; Vladimír SKLENÁŘ a Radovan FIALA

Základní údaje

Originální název

C-13 Chemical Shifts – Structure Relationships In Nucleic Acids

Název česky

Vztah struktury a chemických posunů C-13 v nukleových kyselinách

Autoři

NOVÁK, Petr; Vladimír SKLENÁŘ a Radovan FIALA

Vydání

24th NMR Valtice - Central European NMR Meeting, 2009

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-86441-40-5

Klíčová slova česky

NMR spektroskopie, nukleové kyseliny, struktura, chemický posun

Klíčová slova anglicky

NMR spectroscopy, nucleic acids, structure, chemical shift

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 7. 1. 2010 10:47, doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Anotace

V originále

We have calculated the chemical shifts of carbon nuclei in nucleic acid bases. The structural dependent part of the 13C chemical shifts was calculated as a sum of the contributions of the ring current shift, magnetic anisotropy (calculated by program NUCHEMICS), and the electric field effect (calculated by program MOLMOL). The calculated contributions were added to the experimental shift values of free mononucleotide triphosphates assumed to be free of the effects of stacking and base-pairing interactions. The resulting chemical shifts were found to be rather sensitive to even slight structural changes. This confirms that 13C shifts are sensitive monitors of structural features, on the other hand, it makes obtaining good agreement with experimental shift values difficult.

Česky

Chemické posuny uhlíku C-13 v bázích nukleových kyselin byly spočteny na základě semiempirických přízpěvků kruhových proudů, magnetické anizotropie, elektrického pole a vodíkové vazby. Výsledky jsou porovnávány s experimentálními daty.

Návaznosti

LC06030, projekt VaV
Název: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím