J 2009

Classification and energetics of the base-phosphate interactions in RNA

ZIRBEL, Craig; Judit ŠPONER; Jiří ŠPONER; Jesse STOMBAUGH; Neocles LEONTIS et. al.

Základní údaje

Originální název

Classification and energetics of the base-phosphate interactions in RNA

Název česky

Klasifikace a energetika báze-fosfátových interakcí v RNA

Autoři

ZIRBEL, Craig (840 Spojené státy); Judit ŠPONER (348 Maďarsko); Jiří ŠPONER (203 Česká republika, garant); Jesse STOMBAUGH (840 Spojené státy) a Neocles LEONTIS (203 Česká republika)

Vydání

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2009, 0305-1048

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10610 Biophysics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 7.479

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00038054

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000270016400002

Klíčová slova anglicky

RNA; base; phosphate; database search; quantum chemical calculations
Změněno: 7. 1. 2010 14:10, prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.

Anotace

V originále

By extracting and superimposing base-phosphate (BPh) interactions from a reduced redundancy subset of 3D structures from the PDB, we identified recurrent phosphate-binding sites on the RNA bases. Quantum chemical calculations were carried out on model systems representing each BPh interaction.

Česky

Extrakcí a superpozicí báze-fosfátových (BPh) interakcí z redukované redundantní sady 3D struktur z PDB jsme identifikovali rekurentní báze-fosfátová vazebná místa v bázích RNA. Kvantově chemické výpočty byly provedeny na modelových systémech reprezentující každou BPh interakci.

Návaznosti

LC06030, projekt VaV
Název: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum