Acquiarium 2009

MATULA, Pavel, Martin MAŠKA, Ondřej DANĚK a Marek VINKLER. Acquiarium 2009. 2009.

Základní údaje

• Originální název: Acquiarium 2009
• Autoři: MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Martin MAŠKA (203 Česká republika, domácí), Ondřej DANĚK (203 Česká republika, domácí) a Marek VINKLER (203 Česká republika, domácí).
• Vydání: 2009.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Software
• Obor: 20206 Computer hardware and architecture
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/09:00038859
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• Klíčová slova anglicky: image acquisition; image correction; automated image analysis; fluorescence microscopy
• Technické parametry: free software distributed as binaries or source-codes; written in C++ language, version 1.6
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

Acquiarium is free software for solving the common pipeline of many spatial cell studies using fluorescence microscopy. It addresses image capture, raw image correction, image segmentation, quantification of segmented objects and their spatial arrangement, volume rendering, and statistical evaluation. The software is designed for processing of a collection of many 3D images. It can be used for analysis of a collection of 2D images or time lapse series of 2D or 3D images as well. It has a modular design and is extensible via plug-ins. The main improvements in the year 2009 are described on http://cbia.fi.muni.cz/projects/acquiarium-versions.html

Návaznosti

• 2B06052, projekt VaV: Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů