ŠMAJS, David, Marie ZOBANÍKOVÁ, Darina ČEJKOVÁ, Petra MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL a Weinstock GEORGE M. Whole genome sequencing of pathogenic and nonpathogenic treponemes: comparison of syphilis and yaws strains with T. paraluiscuniculi. In Clinical Microbiology and Infection, Volume 15, Issue s4, Abstracts of the 19th ECCMID, P1329. Neuveden: European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2009, s. 368. ISSN 1198-743X.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Whole genome sequencing of pathogenic and nonpathogenic treponemes: comparison of syphilis and yaws strains with T. paraluiscuniculi.
Autoři ŠMAJS, David (203 Česká republika, garant), Marie ZOBANÍKOVÁ (203 Česká republika), Darina ČEJKOVÁ (203 Česká republika), Petra MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika), Michal STROUHAL (203 Česká republika) a Weinstock GEORGE M. (840 Spojené státy).
Vydání Neuveden, Clinical Microbiology and Infection, Volume 15, Issue s4, Abstracts of the 19th ECCMID, P1329, s. 368-368, 2009.
Nakladatel European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Finsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.014
Kód RIV RIV/00216224:14110/09:00029916
Organizační jednotka Lékařská fakulta
ISSN 1198-743X
Klíčová slova česky syfilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp pertenue; Treponema paraluiscuniculi
Klíčová slova anglicky syphilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp pertenue; Treponema paraluiscuniculi
Změnil Změnil: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116. Změněno: 8. 4. 2010 14:23.
Anotace
Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) is the causative agent of syphilis, T. pallidum ssp. pertenue (TPE) causes endemic treponematosis yaws, and T. paraluiscuniculi is not infectious to humans but causes venereal spirochetosis in rabbits. The genomes of TPE strain Samoa D and T. paraluiscuniculi strain Cuniculi A were sequenced using several whole-genome sequencing methods. Obtained whole genome sequences were compared to the published sequence of TPA strain Nichols. The genome size of TPA Nichols (1,138,006 bp), TPE Samoa D (1,139,299 bp) and T. paraluiscuniculi Cuniculi A (1,133,391 bp) and the overall gene order is similar in all investigated genomes. More than 50% of Nichols and Samoa D genes encode sequentially identical proteins whereas only 15% of those genes were found in the Cuniculi A and Samoa D genomes. Major sequence changes including frameshifts were found in 88 genes of the Cuniculi A genome when compared to the Nichols genome.
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
VytisknoutZobrazeno: 26. 9. 2024 02:20