a 2010

Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.

POSPÍŠILOVÁ, Petra a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.

Název anglicky

Molecular detection of syphilis treponeme: molecular typing and detection of macrolide resistance

Autoři

Vydání

RUTINNÍ ANALÝZA NUKLEOVÝCH KYSELIN MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝMI TECHNIKAMI 2010, 2010

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

macrolide resistance; Treponema pallidum ssp. pallidum; syphilis
Změněno: 19. 1. 2011 13:24, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Bakterii Treponema pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro a proto nelze aplikovat klasický přístup pro určení rezistence k antibiotikům. Primární detekce genetického materiálu T. pallidum u klinických vzorků zahrnovala dvoukrokovou PCR dvou nezávislých treponemálních lokusů (polA = TP0105 a tmpC = TP0319). U pozitivních vzorků byly opět dvoukrokovým PCR protokolem amplifikovány sekvenčně variabilní úseky hypotetických genů TP0136 a TP0548 a lokus 23S rDNA. Amplikony hypotetických genů byly sekvencovány dideoxynukleotidterminátorovou metodou s pomocí původních amplifikačních a interních sekvenačních primerů. Amplikon 23S rDNA byl podroben restrikčnímu testu Mbo II/Bsa I s cílem zjistit přítomnost mutací A2058G a A2059G podmiňujících rezistenci k makrolidům. Zavedli jsme nový typovací systém s diskriminační schopností 8 subtypů u vzorků od 32 pacientů. Získané výsledky dále naznačují, že geneticky kódovaná rezistence k makrolidům je u syfilis v České republice relativně častá (36,4 %).

Anglicky

The summarizes methods of molecular detection of syphilis treponeme including molecular typing of individual strains and detection of macrolide resistance mutattions.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů