KAMAL, Sharaf, Lucie HOROVÁ, Tomáš PAVLÍČEK, Nevo EVIATAR a Petr BUREŠ. Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel. Online. Journal of Stored Products Research. Amsterdam, New York: Elsevier, 2010, roč. 46, č. 1, s. 34–37. ISSN 0022-474X. [citováno 2024-04-24]
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel
Název česky Velikost genomu a genomický poměr bází u Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae): rozdíly mezi přírodními a skladištními populacemi v Izraeli
Autoři KAMAL, Sharaf (376 Izrael), Lucie HOROVÁ (203 Česká republika, domácí), Tomáš PAVLÍČEK (376 Izrael), Nevo EVIATAR (376 Izrael) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, garant, domácí)
Vydání Journal of Stored Products Research, Amsterdam, New York, Elsevier, 2010, 0022-474X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.438
Kód RIV RIV/00216224:14310/10:00043493
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000276115400006
Klíčová slova česky velikost genomu; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia
Klíčová slova anglicky Genome size; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D., učo 2635. Změněno: 29. 4. 2013 12:08.
Anotace
In this study, flow cytometry was used for assessing and comparing the genome size (GS) and the whole genome base composition (AT/GC ratio) of the saw toothed grain beetle Oryzaephilus surinamensis (L.). In addition, the presence and frequency of endosymbiotic Wolbachia bacteria was studied. The haploid GS was estimated to lie within the range from 151.5 to 154 Mbp in O. surinamensis, making it the smallest value of haploid GS known among beetles. Furthermore, it was found that in eight silo pest populations GS was significantly smaller than in eight feral (native) populations obtained from fallen oak acorns. The ability of O. surinamensis to colonize different habitats globally could be connected with an unusually ATrich (for an invertebrate) genome (ATbase content ranging from 68 to 76%). Native (feral) populations of O. surinamensis appear to have genetically diverged from the storage-pest populations tested.
Anotace česky
Průtoková cytometrie byla použita pro stanovení a srovnání velikosti genomu a genomové složení bazí (poměr AT/GC) u skladištního brouka Oryzaephilus surinamensis (L.). V trávicím traktu tohoto brouka byla dále studována přítomnost endosymbiotické bakterie Wolbachia. Srovnáním s interními standardami s odpovídající velikostí genomu stanovenou sekvenováním (Oryza sativa subsp. japonica Nipponbare, Arabidopsis thaliana Columbia, samičí linie Drosophila melanogaster) byla haploidní velikost genomu stanovena v rozmezí od 151.5 do 154 Mbp u studovaného O. surinamensis. Tato velikost je dosud nejmenší známou velikostí u brouků (Coleoptera). U osmi skladištních populací byla velikost genomu signifikantně menší než u osmi přirozených populací živících se dubovými žaludy. Schopnost O. surinamensis kolonizovat různé habitaty může být spojena s neobvykle AT bohatým (ve srovnání s jinými bezobratlými) genomem (obsah AT-bazí kolísá od 68 do 76%). Přirozané (ferální) populace O. surinamensis jsou více geneticky diverzifikované než populace skladištní.
Návaznosti
LC06073, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměrNázev: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
VytisknoutZobrazeno: 24. 4. 2024 08:39