2009
Nové možnosti využití metody GISH u rostlin
MARKOVÁ, Michaela; Boris VYSKOT a Petr BUREŠZákladní údaje
Originální název
Nové možnosti využití metody GISH u rostlin
Název anglicky
New possibilities of using the GISH method in plants
Autoři
MARKOVÁ, Michaela; Boris VYSKOT a Petr BUREŠ
Vydání
5. Metodické dny, 2009
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00029967
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISSN
Klíčová slova česky
GISH fylogenetika Silene Eleocharis
Klíčová slova anglicky
GISH phylogenetics Silene Eleocharis
Změněno: 16. 3. 2010 15:18, RNDr. Michaela Exlerová, Ph.D.
V originále
Metoda genomové in situ hybridizace (GISH) je známou a všeobecně používanou variantou klasické fluorescenční hybridizace (FISH). Na chromozomy je při GISH hybridizována celá genomové DNA (gDNA) a je používána především pro rozlišení rodičovských chromozomů v mezidruhových hybridech či polyploidech a také ke sledování interakce rodičovských genomů. Zde se zaměříme na dvě nové oblasti využití GISH a to pro karyopypování rostlinných chromozomů a pro fylogenetické analýzy rostlinných druhů. Tyto inovace byly otestovány na modelovém rodu Silene L. z čeledi Caryophyllaceae (hvozdíkovité), který představuje jedinečný systém pro studium determinace pohlaví a evoluce pohlavních chromozomů u rostlin. Výzkum nyní pokračuje na rodu Eleocharis R. Br. z čeledi Cyperaceae (šáchorovité), který je z cytogenetického hlediska zajímavý rozmanitostí v počtu a velikosti chromozomů u jednotlivých druhů a především přítomností holocentrických (holokinetických) chromozomů
Anglicky
GISH is a well recognized technique, but its modifications and applications have not been widely used. Here, we show how modifications to the GISH technique can be used as tools to paint plant chromosomes. In addition, we describe novel applications, e.g. how GISH banding could be used for karyotyping plant chromosomes. We further discuss recent phylogenetic applications of GISH that allow a semiquantitative signal analysis and the possibility of comparing and combining this cytogenetic technique with DNA sequence-based phylogenetic trees.
Návaznosti
| GA206/09/1405, projekt VaV |
|