a 2009

Quantification of retrotransposons in Eleocharis using degenerate real-time PCR

ZEDEK, František, Olga ROTREKLOVÁ, Lucie HOROVÁ, Jakub ŠMERDA, Petr BUREŠ et. al.

Základní údaje

Originální název

Quantification of retrotransposons in Eleocharis using degenerate real-time PCR

Název česky

Kvantifikace retrotranspozonů v rodě Eleocharis pomocí degenerované real-time PCR

Autoři

ZEDEK, František (203 Česká republika, garant), Olga ROTREKLOVÁ (203 Česká republika), Lucie HOROVÁ (203 Česká republika), Jakub ŠMERDA (203 Česká republika) a Petr BUREŠ (203 Česká republika)

Vydání

2009

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00039877

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISSN

Klíčová slova česky

retrotranspozony velikost chromozómů velikost genomu Eleocharis evoluce

Klíčová slova anglicky

retrotransposons chromosome size genome size Eleocharis evolution
Změněno: 1. 4. 2010 15:16, Mgr. František Zedek, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

The genus Eleocharis (Cyperaceae) comprises about 200 species of marsh and wetland habitats. Compared to the most of angiosperm genera Eleocharis species are unique in their karyological features. They differ considerably in 1C genome sizes (21.4 fold from 0.42 pg in E. cellulosa to 9 pg in E. uniglumis subsp. sterneri) and average chromosome sizes (roughly 150 fold from about 2 Mbp in E. cellulosa to 299 Mbp in E. xyridiformis). In Eleocharis, genome size and average chromosome size increase towards phylogeneticaly advanced species. The aim of this study was to consider the role of retrotransposons in such phenomenon.

Česky

Rod Eleocharis (Cyperaceae) zahrnuje asi 200 druhů. Z karyologického hlediska má Eleocharis mezi ostatními rostlinami unikátní postavení. Zástupci rodu Eleocharis se významě liší ve velikostech genomu (od 0,42 pg u Eleocharis cellulosa do 9 pg u E. uniglumis subsp. sterneri) a průměrných velikostech chromozómů (od asi 2 Mbp u E. cellulosa fo 299 Mbp u E. xyridiformis). Velikost genomu a průměrná velikost chromozómů vzrůstá s fylogenetickou odvozeností druhů rodu Eleoharis. Tato studie se zaměřuje na roli retrotranspozonů v tomto trendu.

Návaznosti

LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase