Improving Accuracy of Optical Flow of Heeger's Original Method on Biomedical Images

ULMAN, Vladimír. Improving Accuracy of Optical Flow of Heeger's Original Method on Biomedical Images. In Proceedings of the 7th International Conference on Image Analysis and Recognition, ICIAR 2010. Povoa de Varzim (Portugal): Springer. s. 263-273. ISBN 978-3-642-13771-6. doi:10.1007/978-3-642-13772-3_27. 2010.

Základní údaje

• Originální název: Improving Accuracy of Optical Flow of Heeger's Original Method on Biomedical Images
• Název česky: Vylepšení přesnosti optického toku na základě původní Heegerovy metody na biomedicínských obrazech
• Autoři: ULMAN, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: Povoa de Varzim (Portugal), Proceedings of the 7th International Conference on Image Analysis and Recognition, ICIAR 2010, od s. 263-273, 11 s. 2010.
• Nakladatel: Springer

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
• Stát vydavatele: Německo
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Forma vydání: tištěná verze "print"
• WWW: URL
• Impakt faktor: Impact factor: 0.402 v roce 2005
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/10:00067184
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• ISBN: 978-3-642-13771-6
• ISSN: 0302-9743
• Doi: http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-13772-3_27
• UT WoS: 000280464100027
• Klíčová slova česky: optický tok založený na počítání energií zpracování obrazu
• Klíčová slova anglicky: energy-based optical flow image processing
• Štítky: CBIA, cbia-web
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

The paper is focused on the computation of optical flow from time-lapse 2D images acquired from fluorescence optical microscope. The Heeger's traditional established method based on spatio-temporal filtering is adopted and modified in order to solve issues that arose from this sort of image data. In particular, a scheme for effective and fast computations of complex Gabor convolutions is used. The filter tuning is changed to better support the detection of movement. The least squares fitting of the original method is also revised. A parametric study was conducted to assess optimal parameters. With optimal parameters, the proposed method showed lower average angular errors than the original. C++ implementation is available on the author's web pages.

Anotace česky

Článek je zaměřený na výpočet optického toku z časových 2D obtazů pořízrných na fluoroscenčním optickém mikroskopu. Heegerova původní a zavedená metoda, jež je založená na filtrování obrazů, byla použita a modifikována za účelem zprovoznění metody nad tímto typem obrazových dat. Konkrétně, je použito schéma pro efektivní a rychlé počítání konvolucí s komplexními Gáborovými filtry. Filtry mají nové nastavení tak, aby lépe detekovaly pohyby. Fitování pomocí metody nejmenších čtverců bylo také poupraveno. V práci byla provedena parametrická studie, pomocí které bylo nalazeno optimální nastavení metody. S tímto nastavením se ukázalo, že upravený výpočet optického toku dosahuje nižších úhlových chyb než původní postup. Implementace postupů v C++ je dostupná na autorových webových stránkách.

Návaznosti

• LC535, projekt VaV: Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii

• MSM0021622419, záměr: Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy

• MUNI/A/0914/2009, interní kód MU: Název: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace (Akronym: SV-FI MAV)

Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

• 2B06052, projekt VaV: Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů