a 2010

LC-MS/MS Monitoring Human Plasma Proteins Potentionally related to Graft-versus-Host Disease

JEDLIČKOVÁ, Lenka; Jiří BRZOBOHATÝ; Jitka KABÁTHOVÁ; Jan VERNER; Šárka POSPÍŠILOVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

LC-MS/MS Monitoring Human Plasma Proteins Potentionally related to Graft-versus-Host Disease

Název česky

Sledování proteinů pravděpodobně souvisejících s GVHD v lidské plazmě pomocí LC-MS/MS

Autoři

Vydání

2010

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Maďarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/10:00040778

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

978-963-7067-20-4

Klíčová slova česky

GVHD; biomarkery; LC-MS/MS

Klíčová slova anglicky

GVHD; biomarkers; LC-MS/MS

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 21. 7. 2010 14:20, prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.

Anotace

V originále

The aim of this study was to develop a reliable and sensitive method for determination of potential biomarkers in human plasma for early GVHD detection. Blood plasma was immunodepleted by MARS Hu-14 to remove fourteen most abundant proteins. The immunodepleted plasma samples were fractionated by LC capillary system on a reverse phase (mRP C18, Agilent) in water/acetonitrile gradient and subsequently digested with trypsin. The resulting peptides were analyzed using LC-MS/MS in autoMS/MS mode.

Česky

Cílem práce bylo navrhnout a optimalizovat spolehlivou a citlivou metodu pro stanovení potencionálních biomarkerů v lidské plazmě pro časnou detekci GVHD. Plazma byla zbavena 14 nejvíce zastoupených proteinů pomocí kolonky MARS Hu-14, po té byly vzorky frakcionovány na reversní fázi na LC. Frakce byly digestovány trypsinem a analyzovány pomocí nanoLC-MS/MS.

Návaznosti

GD204/08/H054, projekt VaV
Název: Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NS9683, projekt VaV
Název: Změny genomu a proteomu u leukemických pacientů s reakcí štěpu proti hostiteli (GvHD)
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Změny genomu a proteomu u leukemických pacientů s reakcí štěpu proti hostiteli (GvHD)