2010
grid-CICADA: Efficient Explorer of Conformational Space of Biomolecular Systems
ŠTĚPÁN, Jakub, Petr KULHÁNEK, Zdeněk KŘÍŽ, Jan KMUNÍČEK, Jaroslav KOČA et. al.Základní údaje
Originální název
grid-CICADA: Efficient Explorer of Conformational Space of Biomolecular Systems
Autoři
ŠTĚPÁN, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí), Petr KULHÁNEK (203 Česká republika, domácí), Zdeněk KŘÍŽ (203 Česká republika, domácí), Jan KMUNÍČEK (203 Česká republika, domácí), Jaroslav KOČA (203 Česká republika, domácí) a Luděk MATYSKA (203 Česká republika, domácí)
Vydání
5th EGEE User Forum, 2010
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Prezentace na konferencích
Obor
10403 Physical chemistry
Stát vydavatele
Švédsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Kód RIV
RIV/00216224:14310/10:00051414
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky
CICADA; PES; konformační prostor; folding proteinů; gridové vysoko-kapacitní výpočty; distribuované výpočty
Klíčová slova anglicky
CICADA; PES; conformational space; folding; grid high-throughput computing; distributed computing
Změněno: 21. 3. 2012 14:37, Mgr. Anísa Kabarová
Anotace
V originále
Knowledge of conformational space is essential in assessment of dynamical behaviour of biomolecules, which is important, for example, in drug design and folding studies. Unfortunately, systematic exploration of conformational space is impossible due to its high complexity. To circumvent this problem, we have developed the program CICADA that tries to rationalize the search in such a space. In this work, we will demonstrate utilization of innovated version of CICADA in the grid environment during the study of selected middle size biomolecules.
Návaznosti
| LC06030, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622413, záměr |
|