D 2010

Gelová elektroforéza osmiem značených oligonukleotidů s následnou detekcí kovu pomocí LA-ICP-MS

DOSOUDILOVÁ, Klára; Hana NEJEZCHLEBOVÁ; Pavel KOSTEČKA; Libuše TRNKOVÁ; Miroslava BITTOVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Gelová elektroforéza osmiem značených oligonukleotidů s následnou detekcí kovu pomocí LA-ICP-MS

Název anglicky

Gel electrophoresis of osmium-labelled oligonucleotides with subsequent metal detection by LA-ICP-MS

Autoři

DOSOUDILOVÁ, Klára; Hana NEJEZCHLEBOVÁ; Pavel KOSTEČKA; Libuše TRNKOVÁ a Miroslava BITTOVÁ

Vydání

Pardubice, Sborník 14. česko – slovenské spektroskopické konference, 100 s. 2010

Nakladatel

Spektroskopická společnost Jana Marka Marci

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/10:00044424

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-7395-282-2

Klíčová slova anglicky

oligonucleotides; OsO4; gel electrophoresis
Změněno: 18. 1. 2013 19:50, Mgr. Miroslava Bittová, Ph.D.

Anotace

V originále

Nukleové kyseliny (NK), respektive nukleotidy obsažené v jejich struktuře, mohou interagovat s vybranými sloučeninami a komplexy kovů, čehož lze využít při studiu jejich struktury a vlastností. Příkladem je značení pyrimidinových bází směsí oxidu osmičelého (OsO4) a dusíkatého ligandu (L), kdy dochází ke vzniku ternárních komplexů. Díky selektivitě takového značení k jednotlivým bázím lze sledovat například bodové mutace nebo jiná poškození DNA. Nejvyšší tendence k tvorbě komplexu s OsO4 a 2,2 bypiridinem (Os,bipy) byla pozorována v pořadí thymin; methylcytosin; uracil; cytosin. Při tomto značení však velmi záleží na pozici pyrimidinu v rámci oligonukleotidového řetězce. Krajní pozice se modifikují ochotněji než pozice uvnitř řetězce, navíc pozice dvou pyrimidinů vedle sebe jejich značení zpomaluje

Anglicky

Nucleic acids (NA) respl nucleotides contained in their structure can interact with selected compounds and metal complexes which can be utilized in study of their structure and properties. An example is labelling of pyrimidine bases with a mixture of OsO4 and nitrogen ligand (L) when ternary complexes are formed. Due the selectivity of such labelling towards particular bases we can study e. g. site mutations or another DNA damages. The tendency to complex formation with OsO4 and 2,2 bypiridine was observed in the range thymine, methylcytosine, uracil, cytosine. The position of pyrimidine is also important for the modification. The outer positions are modified more easily than inner ones, and two pyrimidines in proximity are labelled more slowly.

Návaznosti

LC06035, projekt VaV
Název: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu