2010
Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.
RÉBLOVÁ, Kamila; Filip RÁZGA; Wen LI; Haixiao GAO; Joachim FRANK et al.Základní údaje
Originální název
Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.
Název česky
Dynamika ribosomálního A-site fingeru odhalená molekulově dynamickými simulacemi a Cryo-EM.
Autoři
Vydání
Nucleic Acids Research, 2010, 0305-1048
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10403 Physical chemistry
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 7.836
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/10:00044908
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
Klíčová slova anglicky
Kink-turn; RNA flexibility; Molecular Dynamics; Ribosome function
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 30. 9. 2010 16:10, prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
V originále
We carried out molecular dynamics simulations of the base of the A-site finger from archaeal and three bacterial large subunits. The study showed that despite noticeable differences in the secondary structures, the studied segments adopt almost identical fold and exhibit similar stochastic fluctuations. Geometries of segments from the simulations correspond to structures obtained by Cryo-electron microscopy.
Česky
Provedli jsme molekulově dynamické simulace ohnutých segmentů A-site fingeru z velké podjednotky archeálního ribozómu a ze třech velkých podjednotek ribozómů bakteriálních. Studie ukázala, že ačkoli mají studované ribozomální segmenty nekonzervované sekundární struktury, mají téměř identické prostorové uspořádání a vykazují podobné stochastické fluktuace. Geometrie segmentů ze simulací odpovídají strukturám, které byly získány pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Návaznosti
| MSM0021622413, záměr |
|