J 2010

On the Role of the cis Hoogsteen:Sugar-Edge Family of Base Pairs in Platforms and Triplets: Quantum Chemical Insights into RNA Structural Biology

SHARMA, Purshotam; Judit SPONER; Jiří ŠPONER; Sitansh SHARMA; Dhananjay BHATTACHARYYA et. al.

Základní údaje

Originální název

On the Role of the cis Hoogsteen:Sugar-Edge Family of Base Pairs in Platforms and Triplets: Quantum Chemical Insights into RNA Structural Biology

Autoři

SHARMA, Purshotam (356 Indie); Judit SPONER (348 Maďarsko); Jiří ŠPONER (203 Česká republika, garant); Sitansh SHARMA (356 Indie); Dhananjay BHATTACHARYYA (356 Indie) a Abhijit MITRA (356 Indie)

Vydání

Jouranl of Physical Chemistry B, 2010, 1520-6106

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10403 Physical chemistry

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.603

Kód RIV

RIV/00216224:14310/10:00044910

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000275047900024

Klíčová slova anglicky

quantum chemistry; base pairs; cis Hoogsteen/Sugar edge
Změněno: 30. 9. 2010 16:06, prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.

Anotace

V originále

Base pairs belonging to the cis Hoogsteen/sugar-edge (H:S) family play important structural roles in folded RNA molecules. We report results of analysis of 30 representative examples spanning 16 possible base pair combinations. The study, involving alternative classification of base pairs and triplets, provides insights into intrinsic properties of these base pairs and their possible structural and functional roles.

Česky

Páry bází patřící do cis Hoogsteen/sugar-edge rodiny hrají důležitou strukturní roli v zfoldovaných molekulách RNA. Shrnujeme výsledky analýz 30 representativních příkladů zahrnujících 16 možných kombinací párování. Studie zahrnující alternativní klasifikaci párování a tripletů poskytuje pohled do vnitřních vlastností těchto párů bází a jejich možných strukturních a funkčních rolí.

Návaznosti

MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím