2010
Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach
BOUCHAL, Pavel; Monika MUDROCHOVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Iva STRUHÁROVÁ et al.Základní údaje
Originální název
Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach
Název česky
Vyhledávání biomarkerů metastazování u low-grade karcinomů prsu: Integrovaný přístup na bázi proteomiky
Autoři
BOUCHAL, Pavel; Monika MUDROCHOVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Iva STRUHÁROVÁ; Lenka HERNYCHOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Spiros D. GARBIS; Roman HRSTKA; Petr MÜLLER; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK
Vydání
XXII. Biochemický zjazd: The Book of Abstracts, 2010
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Vyžádané přednášky
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Slovensko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Označené pro přenos do RIV
Ne
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
978-80-88866-83-1
Klíčová slova česky
rakovina prsu; uzlinové metastáze; proteomika
Klíčová slova anglicky
breast cancer; lymph node metastasis; proteomics
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 24. 3. 2017 18:21, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
V originále
Our effort has been focused on biomarker discovery in the set of 96 breast cancer tumors divided into groups according to grade and presence or absence of lymph node metastases. Three proteomics approaches were involved in complex protein analysis of tissue lysates: (i) SELDI-TOF MS enabled us to quantify 130 intact protein peaks. One protein peak correlating with lymph node metastases was detected and identified. (ii) Selected set of tumors was analyzed using iTRAQ-2DLC-MS/MS approach. This approach provides a simultaneous identification and quantitation of more than 600 proteins. (iii) Set of selected tumor lysates was analyzed also using 2-D SDS-PAGE. The expression variability of 26 selected gene products was validated using qRT-PCR. Generally, our results indicate the differential expression of (i) cytoskeletal proteins, (ii) AGR protein family members and (iii) proteins involved in heme biosynthesis.
Česky
Naše práce je zaměřena na vyhledávání biomarkerů metastazování v souboru 96 primárních nádorů prsu rozdělených podle grade a přítomnosti uzlinových metastáz. K tomuto účelu byly použity následující proteomické přístupy: (i) SELDI-TOF MS nám umožnilo kvantifikovat 130 píků intaktních proteinů, přičemž byl detegován a identifikován jeden pík korelující se stavem uzlinových metastáz. (ii) Vybarný soubor primárních nádorů byl analyzován pomocí metodiky iTRAQ-2DLC-MS/MS. Tento přístup umožňuje současnou identifikaci a vantifikaci více než 600 proteinů. Diferenciálně experimované proteiny náleží do několika funkčních skupin, které byly podrobně popsány v prezentaci. (iii) Vybraný soubor nádrových lyzátů byl analyzován také pomocí 2-D PAGE. Navíc, expresní profily 26 genových produktů byly evaluovány pomocí qRT-PCR. V souhrnu naše výsledky naznačují rozdílnou expresi cytoskeletálních proteinů, proteinů rodiny anterior-gradient a proteinů zapojených do biosystézy hemu.
Návaznosti
| GAP304/10/0868, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622413, záměr |
| ||
| MZ0MOU2005, záměr |
|