BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Zbyněk BORTLÍČEK, Iva STRUHÁROVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Spiros D. GARBIS, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER, Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. In XXII. Biochemický zjazd: The Book of Abstracts. 2010. ISBN 978-80-88866-83-1.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach
Název česky Vyhledávání biomarkerů metastazování u low-grade karcinomů prsu: Integrovaný přístup na bázi proteomiky
Autoři BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Zbyněk BORTLÍČEK, Iva STRUHÁROVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Spiros D. GARBIS, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER, Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK.
Vydání XXII. Biochemický zjazd: The Book of Abstracts, 2010.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Vyžádané přednášky
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Slovensko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-88866-83-1
Klíčová slova česky rakovina prsu; uzlinové metastáze; proteomika
Klíčová slova anglicky breast cancer; lymph node metastasis; proteomics
Příznaky Mezinárodní význam
Změnil Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 24. 3. 2017 18:21.
Anotace
Our effort has been focused on biomarker discovery in the set of 96 breast cancer tumors divided into groups according to grade and presence or absence of lymph node metastases. Three proteomics approaches were involved in complex protein analysis of tissue lysates: (i) SELDI-TOF MS enabled us to quantify 130 intact protein peaks. One protein peak correlating with lymph node metastases was detected and identified. (ii) Selected set of tumors was analyzed using iTRAQ-2DLC-MS/MS approach. This approach provides a simultaneous identification and quantitation of more than 600 proteins. (iii) Set of selected tumor lysates was analyzed also using 2-D SDS-PAGE. The expression variability of 26 selected gene products was validated using qRT-PCR. Generally, our results indicate the differential expression of (i) cytoskeletal proteins, (ii) AGR protein family members and (iii) proteins involved in heme biosynthesis.
Anotace česky
Naše práce je zaměřena na vyhledávání biomarkerů metastazování v souboru 96 primárních nádorů prsu rozdělených podle grade a přítomnosti uzlinových metastáz. K tomuto účelu byly použity následující proteomické přístupy: (i) SELDI-TOF MS nám umožnilo kvantifikovat 130 píků intaktních proteinů, přičemž byl detegován a identifikován jeden pík korelující se stavem uzlinových metastáz. (ii) Vybarný soubor primárních nádorů byl analyzován pomocí metodiky iTRAQ-2DLC-MS/MS. Tento přístup umožňuje současnou identifikaci a vantifikaci více než 600 proteinů. Diferenciálně experimované proteiny náleží do několika funkčních skupin, které byly podrobně popsány v prezentaci. (iii) Vybraný soubor nádrových lyzátů byl analyzován také pomocí 2-D PAGE. Navíc, expresní profily 26 genových produktů byly evaluovány pomocí qRT-PCR. V souhrnu naše výsledky naznačují rozdílnou expresi cytoskeletálních proteinů, proteinů rodiny anterior-gradient a proteinů zapojených do biosystézy hemu.
Návaznosti
GAP304/10/0868, projekt VaVNázev: Studium molekulárních mechanismů časného metastazování do lymfatických uzlin u karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomických technik
Investor: Grantová agentura ČR, Studium molekulárních mechanismů časného metastazování do lymfatických uzlin u karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomických technik
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MZ0MOU2005, záměrNázev: Funkční diagnostika zhoubných nádorů
VytisknoutZobrazeno: 11. 5. 2024 15:15