Detailed Information on Publication Record
2010
Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach
BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Zbyněk BORTLÍČEK, Iva STRUHÁROVÁ et. al.Basic information
Original name
Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach
Name in Czech
Vyhledávání biomarkerů metastazování u low-grade karcinomů prsu: Integrovaný přístup na bázi proteomiky
Authors
BOUCHAL, Pavel, Monika MUDROCHOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Zbyněk BORTLÍČEK, Iva STRUHÁROVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Spiros D. GARBIS, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK
Edition
XXII. Biochemický zjazd: The Book of Abstracts, 2010
Other information
Language
English
Type of outcome
Vyžádané přednášky
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Slovakia
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Organization unit
Faculty of Science
ISBN
978-80-88866-83-1
Keywords (in Czech)
rakovina prsu; uzlinové metastáze; proteomika
Keywords in English
breast cancer; lymph node metastasis; proteomics
Tags
International impact
Změněno: 24/3/2017 18:21, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
V originále
Our effort has been focused on biomarker discovery in the set of 96 breast cancer tumors divided into groups according to grade and presence or absence of lymph node metastases. Three proteomics approaches were involved in complex protein analysis of tissue lysates: (i) SELDI-TOF MS enabled us to quantify 130 intact protein peaks. One protein peak correlating with lymph node metastases was detected and identified. (ii) Selected set of tumors was analyzed using iTRAQ-2DLC-MS/MS approach. This approach provides a simultaneous identification and quantitation of more than 600 proteins. (iii) Set of selected tumor lysates was analyzed also using 2-D SDS-PAGE. The expression variability of 26 selected gene products was validated using qRT-PCR. Generally, our results indicate the differential expression of (i) cytoskeletal proteins, (ii) AGR protein family members and (iii) proteins involved in heme biosynthesis.
In Czech
Naše práce je zaměřena na vyhledávání biomarkerů metastazování v souboru 96 primárních nádorů prsu rozdělených podle grade a přítomnosti uzlinových metastáz. K tomuto účelu byly použity následující proteomické přístupy: (i) SELDI-TOF MS nám umožnilo kvantifikovat 130 píků intaktních proteinů, přičemž byl detegován a identifikován jeden pík korelující se stavem uzlinových metastáz. (ii) Vybarný soubor primárních nádorů byl analyzován pomocí metodiky iTRAQ-2DLC-MS/MS. Tento přístup umožňuje současnou identifikaci a vantifikaci více než 600 proteinů. Diferenciálně experimované proteiny náleží do několika funkčních skupin, které byly podrobně popsány v prezentaci. (iii) Vybraný soubor nádrových lyzátů byl analyzován také pomocí 2-D PAGE. Navíc, expresní profily 26 genových produktů byly evaluovány pomocí qRT-PCR. V souhrnu naše výsledky naznačují rozdílnou expresi cytoskeletálních proteinů, proteinů rodiny anterior-gradient a proteinů zapojených do biosystézy hemu.
Links
| GAP304/10/0868, research and development project |
| ||
| MSM0021622413, plan (intention) |
| ||
| MZ0MOU2005, plan (intention) |
|