Informační systém Masarykovy univerzity 

E-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes

česky | in English

ŠAFRÁNEK, David, Jan ČERVENÝ, Matej KLEMENT, Jana POSPÍŠILOVÁ, Luboš BRIM, Dušan LAZÁR a Ladislav NEDBAL. E-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes. BioSystems, Elsevier, 2011, roč. 103, č. 2, s. 115-124. ISSN 0303-2647. doi:10.1016/j.biosystems.2010.10.013.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název E-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes
Autoři ŠAFRÁNEK, David (203 Česká republika, garant, domácí), Jan ČERVENÝ (203 Česká republika), Matej KLEMENT (703 Slovensko, domácí), Jana POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí), Dušan LAZÁR (203 Česká republika) a Ladislav NEDBAL (203 Česká republika).
Vydání BioSystems, Elsevier, 2011, 0303-2647.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Informatika
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.784
Kód RIV RIV/00216224:14330/11:00049652
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.biosystems.2010.10.013
UT WoS 000287278000002
Klíčová slova anglicky Biomodels repository; Computational models; Photosynthesis; Systems biology; Web platform
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159. Změněno: 1. 7. 2013 10:23.
Anotace
E-photosynthesis framework is a web-based platform for modeling and analysis of photosynthetic processes. Compared to its earlier version, the present platform employs advanced software methods and technologies to support an effective implementation of vastly diverse kinetic models of photosynthesis. We report on the first phase implementation of the tool new version and demonstrate the functionalities of model visualization, presentation of model components, rate constants, initial conditions and of model annotation. The demonstration also includes export of a model to the Systems Biology Markup Language format and remote numerical simulation of the model.
Anotace česky
Článek představuje novou verzi webového portálu e-photosynthesis.org pro počítačové modelování procesů fotosyntézy. Oproti minulé verzi je kompletně přebudováno jádro i rozhraní systému. Systém je nyní připraven pro obecnou strukturu diferenciálních modelů kompatibilních s formátem SBML. Rozhraní umožňuje registrovaným uživatelem modifikaci parametrů a tvorbu vlastních simulačních profilů. Vlastní simulace modelů je realizována prostřednictvím ODE solveru Octave a je presentována uživateli prostřednictvím grafického zobrazení simulovaných křivek.
Návaznosti
GA201/09/1389, projekt VaVNázev: Verifikace a analýza velmi velkých počítačových systémů
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
MUNI/A/0914/2009, interní kód MUNázev: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace (Akronym: SV-FI MAV)
Investor: Masarykova univerzita, Grantová agentura MU, Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 20. 9. 2017 23:48

Relevantní odkazy 


Nahoru | Aktuální datum a čas: 20. 9. 2017 23:48, 38. (sudý) týden

Kontakty: istech(zavináč/atsign)fi(tečka/dot)muni(tečka/dot)cz, studijní odd., správci práv, is-technici, e-technici, IT podpora | Použití cookies | Více o Informačním systému